合同采购货款由第三方代付，在符合一定条件下是合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律角度
合同相对性原则：
- 通常情况下，合同具有相对性，即合同的权利义务仅对合同双方产生约束力。在货物买卖合同中，买方有义务支付货款，卖方有义务交付货物。
- 如果合同中没有明确约定货款可以由第三方代付，那么买方擅自让第三方代付可能构成违约，因为卖方有权要求买方本人履行付款义务。
第三方代付的合法性：
- 如果合同双方（买方和卖方）在合同中明确约定了货款可以由第三方代付，或者事后达成了这样的补充协议，那么第三方代付就是合法的。
- 另外，如果卖方实际接受了第三方代付的货款，并且没有提出异议，这也可以视为卖方对第三方代付行为的认可，从而构成对原合同付款方式的变更。
相关法律法规：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。因此，如果合同双方就货款支付方式达成新的合意，包括由第三方代付，那么这种变更就是合法的。
二、实践角度
交易习惯与行业惯例：
- 在某些行业或交易中，可能存在由第三方代付货款的交易习惯或行业惯例。如果这种习惯或惯例被合同双方所接受，并且不违反法律法规的强制性规定，那么第三方代付就是可行的。
风险防控：
- 从风险防控的角度来看，如果允许第三方代付货款，应当确保第三方的代付行为得到合同双方的明确认可，并且有相应的书面证据（如补充协议、确认函等）来证明这种代付行为的合法性。
- 否则，一旦出现纠纷，卖方可能面临无法追讨货款的风险，因为第三方并非合同当事人，其代付行为可能不被法律所认可。
三、建议与注意事项
明确约定：
- 如果希望采用第三方代付的方式支付货款，建议在合同中明确约定相关条款，包括第三方的身份、代付的金额、时间、方式等。
书面确认：
- 如果合同中没有明确约定第三方代付的事项，但事后双方达成了这样的合意，应当及时签订书面补充协议或确认函，以明确双方的权利义务。
风险评估：
- 在接受第三方代付前，卖方应当对第三方的资信情况进行评估，确保其有足够的支付能力，并且代付行为不会给卖方带来不必要的法律风险。
举例说明：假设A公司与B公司签订了一份货物买卖合同，约定A公司向B公司购买一批货物，货款由A公司支付。后来，A公司因资金周转问题，希望由其关联公司C公司代为支付货款。在这种情况下，A公司应当与B公司协商并签订书面补充协议，明确约定由C公司代为支付货款的事项。如果B公司同意并接受了C公司的代付行为，那么这种代付就是合法的。
如果您在合同采购货款由第三方代付方面遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。