核心结论：入职合同丢失且单位已倒闭的情况下，您仍可通过其他证据证明劳动关系，并依法主张相关权益。以下是具体分析及建议：

1. 劳动关系证明的替代方式

入职合同虽丢失，但劳动关系可通过其他证据证明，包括但不限于：

• 工资支付记录：银行流水、转账记录（需显示单位名称或财务人员信息）；
• 社保缴纳记录：社保局出具的缴费明细，可证明单位为您缴纳社保；
• 工作证、工牌、考勤记录：实物或电子考勤记录（如钉钉、企业微信截图）；
• 同事证言：在职或离职同事的书面证言（需附证人身份信息及联系方式）；
• 工作邮件、聊天记录：与单位或客户沟通的邮件、微信记录；
• 单位公告、通知：如入职通知、调岗通知等书面文件。

建议：优先收集工资流水、社保记录等客观证据，此类证据证明力较强。

2. 单位倒闭后的权益主张路径

若单位已进入破产程序，您需通过以下方式主张权益：

• 申报债权：向破产管理人提交劳动关系证明及债权清单（如未结工资、经济补偿金、加班费等）；
• 劳动仲裁前置：若单位未进入破产程序但已停业，可向劳动仲裁委申请仲裁，确认劳动关系并主张权益；
• 优先受偿权：根据《企业破产法》，职工工资、医疗、伤残补助等费用享有优先受偿权，但需在破产财产分配前申报。

关键点：需在破产程序启动后及时申报债权，逾期可能丧失受偿机会。

3. 经济补偿金的计算与主张

若单位因破产终止劳动合同，您有权主张经济补偿金：

• 计算标准：按工作年限，每满1年支付1个月工资（6个月以上按1年计算，不足6个月支付半个月工资）；
• 工资基数：前12个月平均工资（含奖金、津贴等，但不超过当地社平工资3倍）；
• 例外情形：若单位已支付代通知金或双方协商一致解除合同，可能影响补偿金额。

提示：若单位未依法支付补偿金，可向劳动监察部门投诉或申请仲裁。

4. 实务操作建议

• 步骤一：立即收集劳动关系证明材料（优先电子证据，如截图需保留原始载体）；
• 步骤二：联系单位破产管理人（若已破产）或原负责人（若未破产），确认债权申报方式；
• 步骤三：向当地劳动仲裁委提交仲裁申请（若单位未破产且拒不履行义务）；
• 步骤四：关注破产程序进展，及时参与债权人会议。

风险警示：若单位无财产可供执行，可能面临债权无法全额受偿的风险，建议尽早行动。

5. 特殊情形处理

• 未签书面合同：若入职未签合同，可主张双倍工资差额（需证明实际用工关系）；
• 单位主体消亡：若单位未注销但已停业，可起诉股东或出资人（需证明财产混同）；
• 档案转移：若单位拒不转移人事档案，可向劳动监察部门投诉。

总结：合同丢失不影响劳动关系认定，关键在于证据收集。单位倒闭后，需通过破产程序或劳动仲裁主张权益，建议优先咨询专业律师制定具体方案。如有进一步问题，可直接向我提问。