针对您提出的“债务还清后，司法扣划的款项是否会退回来以及应该怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，关于司法扣划的款项是否会退回来，这主要取决于扣划的依据和实际情况。
若扣划依据有误：
- 如果司法扣划是基于错误的法律文书或执行程序，例如法院误判导致的划扣，那么在再审改判后，相关款项应当被返还。
- 另外，如果当事人在债务清偿完毕后，发现有多划扣的部分，这部分款项也应当被退还。
若扣划基于合法有效的法律文书：
- 如果司法扣划是基于合法有效的法律文书，并且当事人确实有应履行的债务，那么扣划的款项通常用于偿还债务，这种情况下款项是不会被退回的。
- 如果您认为扣划行为存在不当之处，例如您认为自己并不存在应履行的债务，或者扣划的金额超出了您应履行的债务范围，您可以通过执行异议程序来主张自己的权利。
接下来，关于您应该怎么办，以下是一些建议：
立即与扣划法院联系：
- 如果您发现自己的账户被司法扣划，首先应当立即与扣划法院取得联系，了解扣划的具体原因和依据。
提出申诉或异议：
- 如果您认为扣划行为存在不当之处，可以向扣划法院提出申诉或异议。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人、利害关系人认为执行行为违反法律规则的，可以向负责执行的人民法院提出书面异议。
- 法院在收到书面异议后，会在十五日内进行审查。如果理由成立，法院会裁定撤销或者改正；如果理由不成立，法院会裁定驳回。
申请复议：
- 如果您对法院的裁定不服，可以自裁定送达之日起十日内向上一级人民法院申请复议。
保留相关证据：
- 在整个过程中，您应当保留好与债务清偿、司法扣划相关的所有证据，以便在需要时提供给法院进行审查。
综上所述，司法扣划的款项是否会退回来取决于扣划的依据和实际情况。如果您认为扣划行为存在不当之处，应当立即与扣划法院联系并提出申诉或异议。希望这些解答能够帮助您更好地理解和处理这个问题。