有残疾的孩子父母离婚时，法院判决抚养权归属的核心原则是“儿童最大利益原则”，即以最有利于孩子成长为出发点进行综合判断。具体来说，法院会从以下几个方面进行考量：

一、年龄因素

1. 不满两周岁的残疾儿童：若母亲有抚养能力且无不宜抚养的情况（如患重病、虐待孩子等），抚养权通常会判给母亲。这是因为幼儿对母亲有天然的依赖，母亲在照顾幼儿方面往往更具优势。
2. 两周岁以上的残疾儿童：法院会综合考虑父母的抚养能力、抚养意愿、生活环境等因素。例如，父母的经济状况、健康状况、居住环境是否利于孩子成长（如靠近优质医疗资源方便康复治疗）、孩子与哪一方的感情更深等。同时，如果孩子有认知能力，其意愿也会被尊重。

二、抚养能力与条件

1. 经济状况：法院会审查双方的经济状况，包括收入、财产等，以确保孩子能够获得足够的生活、教育和医疗费用。对于残疾儿童，因其可能存在特殊医疗、康复等需求，抚养费数额应适当高于普通儿童。
2. 健康状况：父母的健康状况也是法院考虑的因素之一。如果一方患有严重疾病，可能无法胜任抚养孩子的任务。
3. 居住环境：法院会评估双方的居住环境是否利于孩子成长，特别是对于残疾儿童来说，一个安全、舒适且便于接受康复治疗的居住环境尤为重要。

三、特殊需求与照顾

1. 特殊教育需求：如果残疾儿童有特殊的教育需求，法院会倾向于将抚养权判给能够提供更好教育条件的一方。
2. 医疗护理需求：对于需要长期医疗护理的残疾儿童，法院会考虑哪一方能够提供更好的医疗护理条件。

四、后续保障与探视权

1. 抚养费支付：无论抚养权判给哪一方，另一方都应依法承担相应的抚养费用。抚养费的数额通常根据子女的实际需要、父母双方的负担能力和当地的实际生活水平确定。对于残疾儿童，抚养费数额应适当高于普通儿童，以保障其生活和医疗等需求。
2. 探视权保障：不直接抚养孩子的一方享有探视权。法院会规定探视的时间和方式，以确保不直接抚养孩子的一方能够维系与孩子的感情。

五、抚养权变更条件

如果抚养方的情况发生重大变化，如患重病、失去抚养能力等，不利于孩子成长，另一方可以申请变更抚养权。法院会重新进行综合判断，以确保孩子的利益得到最大保障。

举例说明：假设一对父母离婚，他们有一个五岁的残疾儿子需要长期接受康复治疗。在这种情况下，法院可能会倾向于将抚养权判给经济状况较好、居住环境靠近康复机构且能够给予孩子更多关爱和陪伴的一方。同时，法院会规定另一方支付适当的抚养费，并享有探视权。

建议：如果您正面临离婚且对孩子抚养权的归属有疑虑，建议您收集相关证据（如经济状况证明、居住环境证明、医疗护理条件证明等），并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。有问题可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律指导。