行政诉讼被告败诉后，在二审中一般不能提交新证据，但在特定情况下可以提交。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况
根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，被告（即行政机关）应当在收到起诉状副本之日起十五日内向人民法院提交作出行政行为的证据和所依据的规范性文件。这意味着，在行政诉讼的一审阶段，行政机关应当完成证据的收集和提交工作。进入二审程序后，原则上不再接受新的证据，这是为了维护诉讼的效率和公正性，防止行政机关利用二审程序拖延诉讼或补充本应在一审中提交的证据。
二、特殊情况
尽管有上述一般原则，但也存在一些特殊情况，允许行政机关在二审中提交证据：
原告或第三人提出新的事实、理由或证据：
- 如果在一审程序中，原告或第三人提出了其在行政处理程序中没有提出的理由或者证据，且经人民法院准许，被告可以针对这些新事实、理由或证据补充相应的证据。
- 同样地，如果原告或者第三人在第二审程序中提出了新的证据，二审法院也可能要求行政机关针对这些新证据进行答辩并提交相关证据材料。
一审未收集但符合法定条件的证据：
- 根据《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》，如果被告在第一审程序中无正当理由未提供而在第二审程序中提供的证据，一般不能作为认定被诉具体行政行为合法的依据。
- 但是，如果这些证据是在第一审程序中因客观原因（如不可抗力、意外事件等）无法收集的，且该证据对案件事实的认定有重大影响，二审法院可能会考虑采纳。不过，这种情况需要严格审查，确保行政机关不是故意拖延举证或违反法定程序。
其他法定情形：
- 在某些特定情况下，如涉及国家利益、公共利益或他人合法权益的事实认定的，或者涉及依职权追加当事人、中止诉讼、终结诉讼、回避等程序性事项的，二审法院也可能要求行政机关提供相关证据。
三、法律建议
- 行政机关应在一审阶段充分举证：为了避免在二审中陷入被动，行政机关应在一审阶段就充分收集和提交证据，确保证据的完整性和充分性。
- 严格遵守法定程序：如果行政机关确实需要在二审中提交证据，应严格遵守法定程序和要求，确保证据的合法性和关联性。
- 咨询专业律师：由于行政诉讼涉及复杂的法律问题和程序要求，行政机关在面临二审提交证据的问题时，应咨询专业律师的意见和建议，以确保诉讼的顺利进行。
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