办理城镇二次供水问题的行政公益诉讼案，通常涉及以下几个关键步骤，我将结合您提供的参考信息，为您详细阐述：

一、线索发现与初步调查

1. 线索来源：

   • 公益诉讼检察大数据智能化应用平台（如河北省的此类平台）可能会推送二次供水卫生安全隐患线索。
   • 公众举报、媒体曝光或相关行政部门的通报也是线索的重要来源。

2. 初步调查：

   • 检察机关会对线索进行初步核实，了解二次供水单位的基本情况、存在的问题以及可能的影响。
   • 通过走访调查、查阅资料等方式，收集相关证据，如管理制度、卫生许可证、水质检测报告等。

二、立案与调查取证

1. 立案：

   • 经初步调查认为存在二次供水卫生安全隐患，且相关行政机关未依法履职的，检察机关可以立案。

2. 调查取证：

   • 深入调查二次供水单位的具体问题，如管理制度是否完善、是否取得卫生许可证、是否定期清洗消毒设施、水质是否达标等。
   • 收集相关证据，包括现场照片、视频、检测报告、证人证言等。
   • 听取行政机关、二次供水单位以及人民监督员的意见和建议。

三、磋商与督促整改

1. 召开磋商会：

   • 检察机关可以组织召开行政公益诉讼磋商会，邀请相关行政机关、二次供水单位以及人民监督员等参加。
   • 在磋商会上，检察机关详细介绍调查发现的问题隐患，阐述行政机关的职能职责。

2. 达成磋商意见：

   • 经过充分的交流和讨论，各方就分工事项、整改措施以及协作配合等方面达成磋商意见。
   • 行政机关表示将加大对二次供水的监管力度，对发现的问题积极进行整改。

四、跟进监督与效果评估

1. 跟进监督：

   • 检察机关会严格落实相关专项行动和监督工作要求，聚焦民生实事，跟进监督二次供水整改落实情况。
   • 定期或不定期地对二次供水单位进行复查，确保整改措施得到有效执行。

2. 效果评估：

   • 对整改效果进行评估，包括水质是否达标、管理制度是否完善、设施是否得到及时清洗消毒等。
   • 如果整改效果不佳或存在反弹现象，检察机关可以进一步采取措施，如提起行政公益诉讼等。

五、法律程序与诉讼（如需）

如果经过磋商和跟进监督后，相关行政机关仍未依法履职或整改效果不佳，检察机关可以依法向人民法院提起行政公益诉讼，要求行政机关履行职责或确认其行政行为违法。

总结与建议

办理城镇二次供水问题的行政公益诉讼案需要检察机关充分发挥公益诉讼检察职能，通过线索发现、初步调查、立案与调查取证、磋商与督促整改、跟进监督与效果评估等步骤，确保二次供水安全。同时，建议加强与相关行政机关的沟通协作，形成工作合力，共同守护好人民群众用水安全。