明确结论：当员工因交通事故受伤并被认定为工伤时，即使已经获得交通事故赔付的误工费，公司仍然需要支付其停工留薪期间的工伤工资。
法律依据及原理
性质区别：
- 交通事故赔偿中的误工费，是基于侵权责任对受害人因交通事故所遭受的收入损失的补偿。
- 工伤赔偿中的停工留薪期工资，则是基于劳动关系，用人单位对工伤职工在停工治疗期间应享受的工资福利待遇的保障。
相关法律规定：
- 根据《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》的相关规定，依法应当参加工伤保险统筹的用人单位的劳动者，因工伤事故遭受人身损害，应按《工伤保险条例》的规定处理。同时，因第三人侵权造成的损害，赔偿权利人可请求第三人承担民事责任。
- 《工伤保险条例》第三十三条明确规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
具体实践情况
一般情况（兼得模式）：
- 在大多数情况下，职工可以同时获得交通事故侵权赔偿和工伤赔偿，即“双赔”。这是因为误工费和停工留薪期工资在性质和功能上不同，不存在重复赔偿的问题。误工费是对交通事故导致的收入损失的赔偿，而停工留薪期工资是用人单位对工伤职工的工资福利保障。
- 举例：职工小李在上班途中发生交通事故，并被认定为工伤。对方负主要责任，并赔付了小李的误工费。然而，这并不影响小李从公司获得停工留薪期间的工伤工资。公司仍需按照小李的原工资福利待遇标准，支付其停工留薪期间的工资。
特殊情况（补充模式）：
- 在极少数地区或特定情况下，可能采取补充模式。即如果职工已经从交通事故侵权方获得了误工费赔偿，且该金额高于或等于职工本人工资标准，用人单位可能不再支付或补足差额部分的停工留薪期工资。但这种情况非常罕见，且需根据当地的具体法律法规来确定。
法律建议
职工方面：
- 职工有义务向公司如实说明交通事故误工费的赔偿情况，以便公司正确履行工资支付责任。
- 如果公司拒绝支付停工留薪期间的工伤工资，职工可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
公司方面：
- 公司应依据相关法律法规及实际情况，正确履行工资支付责任，避免纠纷。
- 如果对交通事故误工费的赔偿情况有疑问或需要进一步了解，公司可以咨询专业律师或相关机构。
总结：交通事故赔付的误工费与工伤工资的支付是两个独立的法律体系下的赔偿项目，它们之间并不冲突，也不能相互替代。员工因交通事故获得的误工费赔偿，不影响其同时享受工伤保险待遇的权利。因此，即使员工已获得交通事故的误工费赔付，公司仍需按照工伤保险的规定，支付其在停工留薪期间的工伤工资。这是法律赋予员工的合法权益，也是公司应当履行的法定义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。