当行政机关决定不予行政处罚时，其流程通常遵循以下步骤，以确保程序的公正性和合法性：

一、立案环节

行政机关在发现可能的违法案源线索后，会进行初步核查。如果核查后认为不符合立案条件，或者认为应当不予处罚（例如，违法行为轻微且依法可以不予处罚），则此阶段可能终结程序，不再进一步处理。

二、调查取证阶段

若决定继续处理，行政机关将全面收集与案件有关的证据，以查明事实。这一阶段包括：

• 全面调查：行政机关必须全面、客观、公正地调查，收集有关证据。
• 检查与询问：必要时，依照法律、法规的规定，可以进行检查。执法人员不得少于两人，并应向当事人或有关人员出示证件。当事人或有关人员应如实回答询问，并协助调查或检查。
• 证据收集与保存：行政机关在收集证据时，可以采取抽样取证的方法。在证据可能灭失或以后难以取得的情况下，经行政机关负责人批准，可以先行登记保存，并在七日内及时作出处理决定。

若调查后认定当事人存在依法不应处罚的情形（如不满十四周岁的未成年人有违法行为、精神病人在不能辨认或不能控制自己行为时有违法行为等），行政机关应整理相关证据材料，形成调查终结报告。

三、审核环节

法制审核机构将对调查结果进行审核，重点审查案件事实是否清楚、证据是否确凿、适用法律是否正确等。若认定符合不予处罚条件，将提出不予处罚的审核意见。

四、决定环节

行政机关负责人根据审核意见作出不予行政处罚的决定。这一决定是基于对案件事实的全面审查和法律的准确适用。

五、告知环节

行政机关将制作不予行政处罚决定书，并送达当事人。决定书中将明确告知当事人不予处罚的事实、理由和依据，同时告知当事人依法享有的权利（如申请行政复议或提起行政诉讼的权利）。

六、结案环节

案件终结后，行政机关将整理归档相关材料，以备后续查阅或审计。

注意事项

• 程序合法性：整个不予行政处罚的流程必须严格遵循法定程序，确保每一步都合法合规。
• 证据充分性：行政机关在作出不予处罚决定前，必须确保收集到的证据充分、确凿，能够支持其决定。
• 当事人权益保护：在流程中，行政机关应充分保障当事人的合法权益，如告知权、申辩权等。

综上所述，行政机关不予行政处罚的流程包括立案、调查取证、审核、决定、告知和结案等环节。每个环节都有其特定的目的和要求，共同构成了不予行政处罚的完整程序。