针对甲方实际应支付工程款给施工方，但施工方员工工资弄虚作假的情况，处理方式需根据具体情况和法律条款进行综合分析。以下是从不同角度给出的法律建议：
一、从甲方角度出发
核实工资真实性：
- 甲方在支付工程款前，有权要求施工方提供员工工资的详细清单及相关支付凭证，以核实工资的真实性。
- 若发现施工方存在工资弄虚作假的行为，甲方可以拒绝支付相应部分的工程款，直至施工方提供真实、合法的工资支付证明。
合同条款约束：
- 甲方应在与施工方签订的合同中明确约定工资支付的真实性和合法性要求，以及违反该要求的违约责任。
- 若施工方违反合同约定，甲方可以依据合同条款要求施工方承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。
法律途径解决：
- 若施工方拒绝改正工资弄虚作假的行为，甲方可以通过法律途径解决，如向法院提起诉讼或向相关部门举报。
- 在诉讼过程中，甲方需要提供充分的证据证明施工方存在工资弄虚作假的行为，以及该行为对甲方造成的损失。
二、从施工方角度出发
自查自纠：
- 施工方应立即对员工工资进行自查自纠，确保工资支付的真实性和合法性。
- 若发现存在工资弄虚作假的行为，施工方应主动改正，并向甲方提供真实、合法的工资支付证明。
承担法律责任：
- 若施工方拒绝改正工资弄虚作假的行为，将可能面临法律责任，包括但不限于被要求赔偿甲方损失、支付违约金、受到行政处罚等。
- 在严重情况下，施工方还可能面临刑事责任，如因欺诈行为被追究刑事责任。
积极沟通协商：
- 施工方应积极与甲方沟通协商，解释工资弄虚作假的原因（如存在误解或管理漏洞等），并承诺采取措施防止类似情况再次发生。
- 通过沟通协商，施工方可能获得甲方的谅解，并避免法律纠纷的发生。
三、从法律角度出发
依据相关法律法规：
- 根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位（施工方）应按时足额支付劳动者工资，不得克扣或无故拖欠。
- 若施工方存在工资弄虚作假的行为，将可能违反相关法律法规，并面临法律责任。
保护劳动者权益：
- 在处理此类纠纷时，应充分保护劳动者的合法权益。若施工方存在工资弄虚作假的行为，导致劳动者工资被克扣或拖欠，劳动者有权向相关部门投诉或提起诉讼。
- 相关部门或法院在处理此类纠纷时，应依法保障劳动者的合法权益，确保劳动者能够获得应得的工资。
建议您：在处理此类纠纷时，甲方和施工方都应保持冷静和理性，通过合法途径解决纠纷。若无法自行协商解决，可以寻求专业律师的帮助，以确保纠纷得到妥善处理。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。