合作项目完成后再签合同，审计能否通过需视具体情况而定，无法一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同签订时间与审计的关系
合同签订的常规流程：
- 通常，合同应在项目开始前或进行中签订，以明确双方的权利义务，确保项目的顺利进行。
- 若项目完成后才签订合同，可能引发审计上的疑问，如合同的真实性、项目的合规性等。
审计对合同签订时间的要求：
- 审计机构在审计过程中，会关注合同的签订时间是否与项目实际进展相匹配。
- 若合同签订时间明显滞后于项目完成时间，审计机构可能会要求解释原因，并评估其对项目财务和合规性的影响。
二、可能影响审计通过的因素
合同内容的完整性：
- 即使合同在项目完成后签订，只要合同内容完整、明确，且符合相关法律法规和行业规范，审计通过的可能性仍然存在。
- 合同应详细规定项目的范围、价格、付款方式、违约责任等关键条款。
项目执行的合规性：
- 审计机构会关注项目执行过程中是否遵守了相关法律法规和行业规范。
- 若项目执行过程中存在违规行为，即使合同在项目完成后签订，也可能导致审计不通过。
双方协商与解释：
- 若因特殊原因（如紧急情况、双方协商一致等）导致合同在项目完成后签订，双方应提供充分的证据和解释，以证明合同的合法性和合规性。
- 审计机构在评估时，会考虑这些特殊因素对审计结果的影响。
三、法律建议与风险防范
尽量在项目开始前或进行中签订合同：
- 以避免因合同签订时间滞后而引发的审计风险。
- 若因特殊原因无法提前签订合同，应确保在项目完成后尽快签订，并保留相关证据和解释。
确保合同内容的完整性和合规性：
- 合同应明确规定双方的权利义务、项目范围、价格、付款方式等关键条款。
- 合同内容应符合相关法律法规和行业规范，避免因合同条款不明确或违规而导致的审计风险。
积极配合审计工作：
- 在审计过程中，应积极提供相关证据和解释，以证明合同的合法性和合规性。
- 若审计机构提出疑问或要求补充材料，应及时响应并配合完成。
合作项目完成后再签合同，审计能否通过取决于合同内容的完整性、项目执行的合规性以及双方协商与解释的情况。为降低审计风险，建议尽量在项目开始前或进行中签订合同，并确保合同内容的完整性和合规性。若有问题，可以直接向我咨询，我会结合您项目的具体情况，为您提供更详细的法律建议。