您好，关于“农民自建乡镇盖章是否合法”的问题，这主要涉及到农村宅基地审批管理和村民委员会印章使用两个方面的法律规定。
首先，从农村宅基地审批管理的角度来看，根据农业农村部和自然资源部联合发布的《关于规范农村宅基地审批管理的通知》，农村村民住宅用地是由乡镇政府审核批准的。这意味着，在农民申请宅基地和建房的过程中，乡镇政府会进行审核，并出具相关的批准文件。但这个过程并不直接涉及“农民自建乡镇盖章”的行为，而是乡镇政府在履行其审批职责。
其次，关于村民委员会印章的使用，需要明确的是，村民委员会印章是村级公共权力的象征，其管理和使用应当遵循相关法律法规。根据《村民委员会组织法》，乡、民族乡、镇的人民政府对村民委员会的工作给予指导、支持和帮助，但不得干预依法属于村民自治范围内的事项。而“村章乡管”的做法，即乡镇政府管理村委会印章，是早被民政部要求纠正的权力越位行为。村民委员会应当自行管理其印章，并在办理村公共事务和公益事业时依法使用。
现在，针对您提到的“农民自建乡镇盖章”的情况，如果这指的是农民在自建房屋过程中需要乡镇政府盖章确认某些事项，那么这通常是在宅基地审批和建房规划许可的流程中发生的。但重要的是，这个盖章行为应当是基于乡镇政府对农民申请宅基地和建房的合法性、合规性进行审核后的结果，而不是乡镇政府随意干预或管理村委会印章的行为。
总结来说：
农民在申请宅基地和建房时，需要按照规定的流程向乡镇政府提交申请，并经过审核批准。这个过程中可能涉及乡镇政府的盖章确认。
村民委员会印章应当由村委会自行管理，并在办理村公共事务和公益事业时依法使用，乡镇政府不得干预。
“农民自建乡镇盖章”如果指的是在宅基地审批和建房规划许可流程中的盖章行为，那么这是合法的，但应当是基于乡镇政府对申请的合法性、合规性进行审核后的结果。
因此，农民自建过程中涉及乡镇政府盖章的行为，在符合相关法律法规和审批流程的前提下是合法的。但任何超越法定职责或干预村民自治范围的行为都是不合法的。希望这个解答能够帮到您。