劳动合同中请假扣工资是否合法，需根据请假的类型、公司规章制度以及法律法规的规定来综合判断。以下是对此问题的详细分析：

一、合法情况

1. 事假扣工资：

   • 员工因个人原因请事假时，用人单位有权按照其规章制度扣工资。前提是规章制度的制定程序合法，内容合理且已明确告知员工。
   • 事假扣款一般按照“月工资÷21.75×请假天数”来计算（21.75为劳动法规定的月计薪天数），即按照请假的时长和日工资标准来扣除相应工资。但扣除的工资数额不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 病假扣工资（但需保障最低工资标准）：

   • 员工因病需要休息或治疗时，用人单位应遵照相关法律法规的规定，为其核算并发放相应的病假工资或疾病救济费。这部分金额可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
   • 病假工资的计算方式通常为（计算基数÷21.75）×计算系数×病假天数，然后从总工资中扣除相应部分（但需确保剩余工资不低于最低工资标准的80%）。

3. 请假影响工作绩效（需合理评估）：

   • 当员工请假导致其无法完成既定的工作任务或目标，进而对整体绩效产生实质性影响时，用人单位可以依据绩效评估体系扣减绩效工资。但这种扣减必须是基于客观、公正的绩效评估结果，并且扣除的金额和方式应合理。

二、不合法情况

1. 规章制度未经法定程序：

   • 如果用人单位在制定关于劳动报酬、工作时间等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，未经职工代表大会或全体职工讨论，未与工会或职工代表平等协商确定，或未进行公示或告知劳动者，那么相关扣工资的规定可能无效。

2. 扣除金额不合理：

   • 如果扣罚工资的金额过高，导致劳动者的实际工资收入远低于当地最低工资标准，或严重影响劳动者基本生活，这种扣罚可能被认定为不合法。

3. 特定假期不得扣工资：

   • 员工在享受带薪年休假、婚假、产假、陪产假、丧假等法定假期时，用人单位不得随意以请假为由扣工资。这些假期是法律赋予劳动者的基本权益，用人单位应保障员工在这些假期期间的工资待遇。

4. 违反法律法规：

   • 如果用人单位的扣工资行为违反了《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规的强制性规定，那么这种扣工资行为是不合法的。

三、维权途径

如果劳动者认为用人单位扣工资的行为不合法，可以先与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，劳动者应提供充分的证据支持自己的主张，如劳动合同、工资条、请假记录等。

总结与建议：

• 劳动者在请假前应了解公司规章制度和法律法规的规定，以确保自己的权益不受侵害。
• 用人单位在制定规章制度和执行扣工资行为时，应确保合法性和合理性，避免违法扣薪。
• 若权益受损，劳动者应及时通过合法途径维护自己的权益。

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