结论：小股东将借款转入法定代表人个人账户，是否构成个人借款不能一概而论，需结合资金用途、公司制度、双方约定等因素综合判断。以下分情况详细说明：
1. 若资金实际用于公司经营，且符合公司制度或双方约定，可能认定为“公司借款”
- 法律依据：根据《民法典》第六百六十七条，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。若资金实际用于公司经营（如支付货款、发放工资等），且法定代表人作为公司代表接收款项，可能构成公司借款。
- 关键证据：需证明资金用途与公司经营相关（如转账备注“公司借款”、公司财务记录、合同等），且法定代表人行为符合公司授权（如公司章程、股东会决议等）。
- 风险提示：若公司未明确授权法定代表人接收借款，或资金被法定代表人挪作他用，可能引发纠纷，需承担举证责任。
2. 若资金未用于公司经营，或双方明确约定为个人借款，则构成“个人借款”
- 法律依据：根据《民法典》第六百七十九条，自然人之间的借款合同，自贷款人提供借款时成立。若双方明确约定借款为法定代表人个人使用（如转账备注“个人借款”、签订个人借款合同等），则构成个人借款。
- 关键证据：需提供书面约定（如借条、借款合同）、转账记录、沟通记录等，证明双方存在个人借款的合意。
- 风险提示：若法定代表人以个人名义借款但用于公司经营，可能涉及“法人人格否认”（《公司法》第二十条），即股东滥用公司法人独立地位逃避债务，需对公司债务承担连带责任。
3. 若资金用途不明或约定不清，可能引发争议，需结合其他证据综合判断
- 常见情形：转账时未备注用途，或双方未签订书面协议，导致资金性质无法直接认定。
- 解决路径：需通过其他证据（如公司财务记录、证人证言、沟通记录等）证明资金实际用途或双方真实意思表示。
- 风险提示：若无法证明资金用途，可能被推定为个人借款（尤其是法定代表人无法证明资金用于公司时），需承担不利后果。
实务建议
- 明确资金用途：转账时备注“公司借款”或“个人借款”，并保留相关证据（如合同、发票等）。
- 签订书面协议：无论是公司借款还是个人借款，均建议签订书面协议，明确借款主体、用途、期限、利息等。
- 完善公司制度：公司应通过章程或决议明确法定代表人对外借款的权限，避免个人行为与公司行为混同。
如有具体案件或证据材料，可进一步向我提供细节，我将为您详细分析法律风险及应对方案。