当您的机动车在交通事故中承担次要责任，并且发生了车损时，赔偿流程通常遵循以下步骤：

一、交强险赔偿

首先，对方车辆的交强险会在其责任限额内对您的车损进行赔偿。交强险的有责财产损失赔偿限额通常为2000元。这意味着，如果您的车损不超过2000元，那么全部损失将由对方交强险承担。

二、超出交强险限额部分的赔偿

如果您的车损超过了交强险的赔偿限额（即2000元），那么超出部分将按照双方的责任比例进行分担。在机动车次要责任的情况下，您通常需要承担约30%的赔偿份额，而对方则需要承担70%。

举例说明：

假设您的车损总额为10000元。

1. 对方交强险首先赔偿2000元。
2. 剩余的车损为8000元（10000元 - 2000元）。
3. 您承担30%的责任，即2400元（8000元 × 30%）。
4. 对方承担70%的责任，即5600元（8000元 × 70%）。

三、商业保险赔偿（如有）

如果您购买了商业保险（如车损险、三者险等），并且保险合同中包含了相关赔偿条款，那么超出交强险限额且应由您承担的部分，可以由您的商业保险进行赔偿。具体赔偿金额和比例将依据保险合同的约定来确定。

四、理赔流程与所需材料

在车损赔偿过程中，您需要按照保险公司的要求提供相关理赔材料，如交通事故认定书、车损照片、维修发票等。同时，您需要遵循保险公司的理赔流程，包括报案、定损、提交材料、审核、赔付等步骤。

五、注意事项

1. 及时报案：发生交通事故后，您应及时向保险公司和交警部门报案。
2. 保留证据：妥善保管与事故相关的所有证据，包括照片、视频、证人证言等。
3. 了解责任比例：在事故处理过程中，了解并确认双方的责任比例，以便准确计算赔偿金额。
4. 遵循法律程序：在赔偿过程中，遵循相关法律法规和保险合同的规定，确保您的权益得到保障。

综上所述，当您的机动车在交通事故中承担次要责任并发生车损时，赔偿流程通常包括交强险赔偿、超出交强险限额部分的赔偿（按责任比例分担）、商业保险赔偿（如有）以及遵循保险公司的理赔流程。希望这些信息能对您有所帮助。