针对您提出的“事故中次要责任是非机动车负主要责任时车损怎么理赔”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、赔偿原则与责任划分
在交通事故中，若机动车负次要责任，非机动车负主要责任，那么赔偿数额将依照各方责任的相对比重来决定。非机动车方面需要承担大部分的车辆损坏赔偿责任，但机动车作为次要责任方，也需承担其应有的份额。
二、具体赔偿流程与金额计算
交强险赔付：
- 机动车作为责任方，首先会在其交强险（机动车第三者责任强制保险）的责任限额范围内对受害人（包括自身车损）进行赔偿。
- 交强险的赔付不区分责任比例，只要在责任限额内，就会全额赔付。
超出交强险部分的赔付：
- 若车损金额超出交强险的责任限额，则超出部分将按照责任比例进行分担。
- 在此情况下，机动车一方通常承担总损失的30%至40%作为赔偿责任（具体比例可能因地区或事故具体情况而异，但30%是一个常见的参考值）。
- 非机动车一方则承担剩余的主要赔偿责任。
赔偿金额计算：
- 具体赔偿金额需根据车辆损失的详细评估报告进行精确计算。
- 评估报告应详细列出车辆损坏的部位、修复所需的费用等，以便确定最终的赔偿数额。
三、法律依据与支持
《道路交通安全法》第七十六条：
- 该条款规定，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照各自过错的比例分担责任。
《民法典》第一千二百一十三条：
- 该条款指出，机动车发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任的，先由承保机动车强制保险的保险人在强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足部分，由承保机动车商业保险的保险人按照保险合同的约定予以赔偿；仍然不足或者没有投保机动车商业保险的，由侵权人赔偿。
四、特殊情况与注意事项
停运损失赔偿：
- 若机动车因事故导致停运，且存在合理的停运损失，是可以主张非机动车赔偿的。
- 停运损失属于间接财产损失，需提供充分证据（如营运合同、收入流水等）以证明其实际发生和具体数额。
协商与诉讼：
- 双方可先协商赔偿事宜，若协商不成，可通过诉讼途径解决。
- 法院将依据事实和法律确定赔偿金额，保障各方合法权益。
五、实际操作建议
及时报案与评估：
- 事故发生后，应及时向保险公司报案，并联系专业评估机构对车辆损失进行评估。
保留证据：
- 保留好与事故相关的所有证据（如事故现场照片、交警认定书、评估报告等），以便在协商或诉讼过程中使用。
咨询专业人士：
- 若对赔偿事宜存在疑问或争议，建议咨询专业律师或保险代理人，以获取更专业的建议和帮助。
综上所述，当机动车在事故中负次要责任，非机动车负主要责任时，车损的赔偿将依照各方责任的相对比重来决定，并遵循交强险赔付、超出部分按责任比例分担的原则。希望以上解答能对您有所帮助。