若在刑事诉讼中调取证据时遇到单位不配合的情况，可以根据不同主体和情节采取相应的法律措施。以下从几个角度进行分析：
一、单位不配合的法律后果
对于一般单位：
- 根据《刑事诉讼法》及相关规定，公安司法机关有权向有关单位和个人收集、调取证据，有关单位和个人应当如实提供证据。若单位不配合，可能面临法律责任。虽然直接的法律条文可能未明确规定对不配合单位的罚款等具体措施，但单位有义务协助司法机关，否则可能构成妨碍司法行为，依法应承担相应责任。
对于特定单位（如银行、通信公司等）：
- 这些单位通常负有更高的协助义务。例如，银行在接到司法机关的合法调取证据请求时，必须提供相关账户信息。若银行不配合，司法机关可以依据相关法律程序，如向银行发出协助执行通知书，并可对银行进行罚款，甚至追究相关责任人员的法律责任。
二、应对单位不配合的具体措施
与单位沟通协商：
- 首先，可以尝试与不配合的单位进行沟通，了解其不配合的原因，并尝试通过协商解决问题。有时候，单位可能由于内部流程、误解或担心法律风险等原因而不配合，通过沟通可以消除这些障碍。
向司法机关申请协助：
- 若沟通无果，可以向负责调取证据的司法机关（如公安局、检察院或法院）申请协助。司法机关有权责令不配合的单位履行协助义务，并可以采取相应的法律措施确保证据的调取。
依法追究法律责任：
- 对于严重不配合的单位，司法机关可以依法对其采取罚款、拘留等措施，甚至追究相关责任人员的刑事责任。这需要根据具体情节和法律规定来判断和执行。
三、实际操作中的注意事项
确保证据调取的合法性：
- 在调取证据过程中，必须确保所有行为都符合法律规定。这包括调取证据的程序、方式以及使用的法律文书等。只有合法的证据调取行为才能得到法律的保护和支持。
保留相关证据和记录：
- 在与不配合的单位交涉过程中，应保留好所有相关的证据和记录，如沟通记录、协助执行通知书等。这些证据和记录在后续的法律程序中可能起到关键作用。
及时咨询专业律师：
- 遇到单位不配合调取证据的情况时，应及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律建议，并帮助制定合适的应对策略。如果有相关问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。
四、案例分析
假设在某起刑事案件中，需要调取某公司的财务记录作为证据，但该公司以内部规定为由拒绝提供。此时，可以采取以下步骤：
- 与该公司进行沟通，解释调取证据的必要性和合法性。
- 若沟通无果，向负责该案件的检察院申请协助，要求检察院责令该公司提供财务记录。
- 若检察院责令后该公司仍不配合，检察院可以依法对其采取罚款等措施，并追究相关责任人员的法律责任。
遇到单位不配合调取证据的情况时，应保持冷静并依法采取相应的措施。通过沟通协商、向司法机关申请协助以及依法追究法律责任等方式，可以有效地解决这一问题。同时，在实际操作中应注意确保证据调取的合法性、保留相关证据和记录，并及时咨询专业律师。