若法院调取证据时相关方不配合，可采取以下法律措施进行处理：

1. 法院可依法对不配合方采取强制措施
   根据《民事诉讼法》第114条，若负有协助调查义务的单位或个人（如银行、行政机关、企业等）拒不配合法院调取证据，法院可对其主要负责人或直接责任人员处以罚款、拘留；构成犯罪的（如隐匿、伪造证据），依法追究刑事责任。
   操作要点：法院需先发出《协助调查通知书》，明确要求配合的内容及期限；若对方仍拒绝，可直接作出处罚决定。

2. 对当事人不配合的，法院可推定对方主张不成立
   若负有举证责任的当事人（如原告、被告）拒不提交其控制的证据，法院可依据《民事诉讼证据规定》第95条，认定对方主张的事实不存在或证据内容不利于其主张。
   典型场景：如被告掌握关键合同却拒不提交，法院可直接采信原告主张的合同内容。

3. 申请法院责令提交证据
   当事人可向法院提交《责令提交证据申请书》，要求对方提交其控制的证据（如财务账簿、监控录像等）。若对方无正当理由拒不提交，法院可参考第2条规则处理。
   注意：需证明证据由对方控制且与案件基本事实相关。

4. 通过律师调查令获取证据
   在部分地区（如广东、上海），律师可凭法院签发的《律师调查令》向第三方调取证据。若第三方拒不配合，律师可申请法院对其处罚。
   适用范围：通常限于银行账户、婚姻登记、工商档案等公开信息。

实务建议：

• 若您是申请调取证据的一方，需提前准备《证据清单》及《协助调查申请书》，明确证据名称、来源及与案件的关联性；
  
• 若您是被要求配合的一方，需审查法院通知的合法性（如是否超出协助范围），若认为不合理可提出书面异议，但拒不配合可能面临处罚；
  
• 涉及刑事案件时，拒不配合调取证据可能构成《刑法》第307条的“帮助毁灭、伪造证据罪”，最高可处7年有期徒刑。

如有具体案件场景，可进一步说明细节，我将结合证据类型、主体身份等要素提供针对性方案。