在合同纠纷中，若原告仅持有一份合同且被告篡改了合同内容，而原告又缺乏直接证据证明篡改行为时，可通过以下途径维护自身权益：

1. 收集直接证据：

   • 原始文本留存：首先，应仔细检查是否留存有合同签订时的原始文本或副本。这是最直接且有力的证据，能够证明合同在签订时的原始状态。
   • 业务往来记录：同时，留意与合同改动部分相关的业务往来记录，如邮件、聊天记录、交易凭证等。这些记录中可能包含与合同原始内容相符的信息，从而间接证明合同的篡改。

2. 寻找间接证据：

   • 证人证言：若没有直接证据，可以寻找知晓合同签订情况的证人。这些证人可以是合同签订时的在场人员、业务合作伙伴等，他们的证言能够为合同签订时的原始状态提供证明。
   • 合法录音：在与对方协商的过程中，可以通过合法的录音方式固定对方承认合同被改的内容。但需注意，录音必须合法取得，不得侵犯他人隐私或违反法律规定。

3. 申请司法鉴定：

   • 鉴定合同改动：若协商不成，原告可考虑申请司法鉴定。专业的鉴定机构能够鉴定出合同改动的时间、笔迹等情况，从而为原告提供有力的证据支持。
   • 及时采取措施：在整个过程中，原告需及时采取措施，防止证据灭失。因为时间拖得越久，证据灭失的可能性就越大，这会增加维权的难度。

4. 法律程序与策略：

   • 提起诉讼：在收集到一定证据后，原告可以向法院提起诉讼，要求确认合同效力或撤销被篡改的合同条款。
   • 申请证据保全：在诉讼过程中，若担心证据可能灭失或以后难以取得，原告可以向法院申请证据保全，以确保关键证据的留存。
   • 利用举证责任倒置：在某些特定情况下，如被告掌握关键证据而拒不提供时，原告可以主张举证责任倒置，要求被告承担证明合同未被篡改的责任。

5. 注意事项与风险提示：

   • 证据收集的合法性：在收集证据的过程中，原告需确保所有证据的取得均合法合规，不得侵犯他人权益或违反法律规定。
   • 诉讼时效：原告需注意诉讼时效的问题，确保在法定的诉讼时效期间内提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
   • 专业律师协助：鉴于合同纠纷的复杂性和专业性，原告在维权过程中可寻求专业律师的协助，以确保自身权益得到充分保障。

若原告在合同纠纷中面临被告篡改合同且缺乏直接证据的情况，应通过收集直接证据、寻找间接证据、申请司法鉴定以及利用法律程序与策略等多种途径来维护自身权益。同时，也需注意证据收集的合法性、诉讼时效以及寻求专业律师的协助等问题。如有任何法律问题，可直接向我咨询，我将为你提供专业的法律建议。