在工程纠纷中，法院判决的赔偿金额通常不是简单地按股份的百分之多少来确定的。赔偿金额的确定是一个复杂的过程，涉及多个因素，以下从不同角度为您详细分析：
合同约定：
- 如果工程合同中明确规定了违约责任和赔偿方式，包括赔偿金额的计算方法或比例，那么法院在判决时会优先考虑合同约定。但这里的约定并非一定是按股份比例，而是根据合同具体条款来确定。
实际损失：
- 在没有合同明确约定或合同约定不明确的情况下，法院会根据守约方的实际损失来确定赔偿金额。这包括直接损失（如工程修复费用、材料损失等）和间接损失（如预期利润损失、工期延误造成的损失等）。实际损失的计算需要守约方提供充分的证据来支持。
过错程度：
- 法院在判决赔偿金额时，还会考虑双方的过错程度。如果被告方存在重大过错或故意违约，法院可能会判决其承担更高的赔偿责任。相反，如果原告方也存在一定过错，法院可能会相应减轻被告方的赔偿责任。
公平原则：
- 法院在判决时还会遵循公平原则，确保判决结果既不过分偏袒一方，也不过分损害另一方的利益。这要求法院在综合考虑各种因素的基础上，做出一个相对公平、合理的判决。
举例说明：
假设在一个工程纠纷中，原告方因被告方的违约行为遭受了100万元的直接损失和20万元的间接损失。同时，合同中没有明确规定赔偿金额的计算方法。在这种情况下，法院可能会根据原告方的实际损失（120万元）以及双方的过错程度来判决赔偿金额。如果法院认为被告方应承担全部责任，那么可能会判决被告方赔偿原告方120万元；如果法院认为原告方也存在一定过错，那么可能会相应减轻被告方的赔偿责任，比如判决被告方赔偿原告方90万元或100万元等。
法律建议：
- 在签订工程合同时，应明确约定违约责任和赔偿方式，以避免未来发生纠纷时无法确定赔偿金额。
- 在发生纠纷后，应及时收集并保存相关证据，以便在诉讼中证明自己的实际损失和对方的过错程度。
- 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
如果您在工程纠纷中遇到了类似的问题，或者有任何其他法律疑问，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。