结论前置：在民事诉讼中，若原告起诉的是合同违约，但实际合同被认定无效，法院会根据合同无效的法律后果进行处理，具体处理方式需结合案件事实和法律规定综合判断。以下是详细分析：

1. 法院首先会审查合同效力

根据《民法典》第155条，无效的民事法律行为自始没有法律约束力。若被告在答辩中提出合同无效的抗辩，或法院依职权审查发现合同存在无效情形（如违反法律强制性规定、恶意串通损害他人权益等），法院会先对合同效力作出认定。若合同被认定无效，则原告基于违约责任的诉讼请求将失去法律基础。

2. 合同无效后的法律后果

合同无效后，法院会依据《民法典》第157条处理后续问题，具体包括：

• 返还财产：若双方已履行部分合同义务（如支付款项、交付货物），法院会判决返还财产，使双方恢复至合同订立前的状态。例如，原告已支付货款但被告未交货，法院会判决被告返还货款。
• 折价补偿：若财产无法返还或没有必要返还（如货物已消耗），法院会判决折价补偿。例如，原告已使用被告提供的服务，法院可能根据服务价值判决原告支付合理对价。
• 过错赔偿：若合同无效系因一方或双方过错导致（如欺诈、胁迫），法院会判决过错方赔偿对方因此遭受的损失。例如，被告故意隐瞒合同无效事由导致原告损失，需承担赔偿责任。

3. 原告诉讼请求的调整

若原告起诉时仅主张违约责任（如要求支付违约金、继续履行），而合同被认定无效，法院会向原告释明，告知其可变更诉讼请求为基于合同无效的返还、补偿或赔偿。若原告拒绝变更，法院可能驳回其违约责任诉求，但会依法处理合同无效的后果。

4. 特殊情形的处理

• 合同部分无效：若合同部分条款无效但不影响其他部分效力，法院会认定有效部分继续履行，无效部分按上述规则处理。
• 涉外合同无效：若涉及涉外因素，法院会依据冲突规范确定准据法，再判断合同效力及后果。

5. 实务建议

• 原告角度：起诉前应全面审查合同效力，避免因合同无效导致诉求落空。若发现合同可能无效，可同时主张返还、补偿等替代性请求。
• 被告角度：若认为合同无效，应在答辩中明确提出，并准备证据证明无效事由（如违反强制性规定、恶意串通等）。

总结：合同无效时，法院不会支持原告的违约责任诉求，但会依法处理合同无效的后果。具体处理方式需结合合同类型、无效原因及双方过错程度综合判断。若有进一步疑问，可直接向我咨询。