双方协商了货物运输损失后，一般可就协商数额向实际承运人追偿，但具体能否追偿成功，需视实际情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律关系角度
合同相对性原则：
- 如果您与实际承运人之间存在直接的运输合同关系，那么根据合同相对性原则，您有权依据合同条款向实际承运人主张因货物运输损失而产生的赔偿责任。协商确定的数额，若未超出合同约定的赔偿范围或实际损失，通常可作为追偿的依据。
第三方责任：
- 若您并非与实际承运人直接签订运输合同，而是通过其他中间方（如货运代理）进行货物运输，且已与中间方就货物运输损失进行了协商并确定了赔偿数额。在这种情况下，您能否向实际承运人追偿，取决于中间方与实际承运人之间的法律关系以及您与中间方之间的合同约定。如果中间方愿意并能够将其对实际承运人的追偿权转让给您，或者您能够证明实际承运人存在过错并导致货物损失，那么您可能有权向实际承运人追偿。
二、实际追偿过程中的注意事项
证据收集：
- 在追偿过程中，证据的收集至关重要。您需要保留与货物运输损失相关的所有证据，包括但不限于运输合同、货物价值证明、损失评估报告、协商记录等。这些证据将有助于您证明货物损失的存在、损失的程度以及协商数额的合理性。
协商与诉讼：
- 在追偿前，您可以尝试与实际承运人进行协商，看是否能够达成赔偿协议。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决争议，如提起民事诉讼。在诉讼过程中，法院将根据双方提供的证据和法律规定，判断实际承运人是否应承担赔偿责任以及赔偿的具体数额。
时效限制：
- 需要注意的是，向实际承运人追偿可能受到时效限制。根据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定，权利人向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。因此，您需要在规定的时效期间内提起诉讼或采取其他法律措施，以维护自己的合法权益。
三、特殊情况下的追偿
实际承运人无过错：
- 如果货物运输损失是由于不可抗力、货物本身性质或合理损耗等原因造成的，且实际承运人已经尽到了合理的注意义务和采取了必要的措施来防止损失的发生，那么实际承运人可能不承担赔偿责任。在这种情况下，您即使与中间方协商确定了赔偿数额，也可能无法向实际承运人追偿。
中间方责任：
- 如果货物运输损失是由于中间方的过错导致的，如中间方选择了不合适的承运人、未妥善保管货物等，那么您可能需要先向中间方主张赔偿责任。在中间方承担赔偿责任后，如果中间方认为实际承运人应承担部分或全部责任，中间方可以另行向实际承运人追偿。但这并不影响您与中间方之间已经确定的赔偿数额和追偿权利。
建议：在处理此类纠纷时，建议您首先与实际承运人或中间方进行友好协商，看是否能够达成赔偿协议。如果协商无果或您认为协商结果不公平，您可以考虑咨询专业律师并提起民事诉讼以维护自己的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。