在破产清算程序中，债权人起诉破产公司但证据不足时，法院仍可能会立案，但立案并不意味着债权人一定能胜诉。以下从不同角度为您详细分析：

一、法院立案的标准

法院立案主要审查的是起诉是否符合法定条件，而非对案件实体内容进行审理。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉应当满足以下条件：

1. 原告是与本案有直接利害关系的公民、法人或其他组织：在破产清算程序中，债权人作为与破产公司有直接经济利益关系的主体，符合原告资格。
2. 有明确的被告：破产公司作为被告，其身份在破产清算程序中是明确的。
3. 有具体的诉讼请求和事实、理由：债权人需要提出具体的诉讼请求，并简要陈述事实和理由。尽管证据不足，但只要债权人能提供一定的事实基础和理由，法院通常会予以立案。
4. 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖：破产清算程序中的诉讼属于人民法院受理范围，且通常由破产公司所在地或主要财产所在地法院管辖。

二、证据不足对诉讼的影响

虽然法院可能会立案，但证据不足会对债权人的诉讼产生不利影响：

1. 胜诉风险增加：在诉讼过程中，证据是证明债权人主张的关键。如果证据不足，法院可能无法认定债权人的主张成立，从而导致债权人败诉。
2. 诉讼成本增加：为了弥补证据不足，债权人可能需要投入更多的时间和精力去收集证据，这会增加诉讼成本。
3. 可能影响破产分配：在破产清算程序中，债权人的债权需要经过确认后才能参与分配。如果证据不足导致债权无法确认，债权人将无法参与破产分配，从而遭受损失。

三、法律建议

针对证据不足的情况，我建议您采取以下措施：

1. 尽可能收集证据：在起诉前，债权人应尽可能收集与案件相关的证据，如合同、发票、付款记录等。这些证据将有助于证明债权人的主张。
2. 咨询专业律师：在起诉前或诉讼过程中，债权人可以咨询专业律师，了解案件的法律风险和可能的诉讼结果。律师可以根据债权人的具体情况，提供针对性的法律建议。
3. 考虑和解或调解：在证据不足的情况下，债权人可以考虑与破产公司进行和解或调解。通过协商达成一致意见，可以避免诉讼风险，并尽快实现债权。

最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，证据不足对诉讼的影响也会因案件而异。因此，在面临类似情况时，建议您直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更准确的法律建议。