房屋经营性鉴定费用的承担主体，通常根据房屋质量问题的成因、质保期情况以及双方争议焦点来综合确定。以下是对不同情况的具体分析：
房屋质量问题由开发商导致
- 若房屋质量问题是由于开发商施工不当、材料不合格等原因导致，且该问题在质保期内，那么鉴定费用一般由开发商承担。因为开发商有责任确保房屋质量符合相关标准，若出现问题，应承担相应费用。例如，房屋在交付后的一定期限内出现墙体裂缝、屋顶漏水等质量问题，经鉴定确因开发商施工不当造成，那么鉴定费用就应由开发商负责。
房屋质量问题由业主或使用人导致
- 若房屋质量问题是因业主使用不当、装修改造或管理不善等自身原因造成，那么鉴定费用通常由业主自己承担。业主应合理使用房屋，避免因自身行为导致房屋出现质量问题。比如，业主在装修过程中擅自改动房屋结构，导致房屋出现安全隐患，需要进行鉴定，那么鉴定费用就需业主自行承担。
房屋质量问题责任难以确定
- 若房屋质量问题的责任难以确定，比如可能是开发商和业主双方都有一定责任，或者双方对房屋质量是否存在问题存在争议，此时鉴定费可以由双方协商分担。协商不成时，根据具体情况，可能由法院判决由哪一方承担或双方共同承担。例如，双方就房屋墙面裂缝的原因产生争议，开发商认为是业主装修不当所致，而业主则认为是开发商施工问题，双方协商无果后，可以提起诉讼，由法院根据鉴定结果判决鉴定费用的承担方。
特殊情况下的费用承担
- 在某些特殊情况下，如房屋已过质保期，但质量问题是由于开发商在质保期内未履行维修义务导致问题加剧，那么鉴定费用可能仍由开发商承担部分或全部。这需要根据具体案情和法院的判决来确定。
法律建议：
- 在遇到房屋质量问题需要进行鉴定时，建议业主或使用人先与开发商或相关责任方进行协商，明确鉴定费用的承担方。
- 若协商无果，可以寻求法律援助或提起诉讼，通过法律途径解决争议。
- 在整个过程中，应保留好相关证据，如房屋质量问题的照片、视频、鉴定报告等，以便在需要时提供证明。
可能后果：
- 若未能明确鉴定费用的承担方，可能导致鉴定工作无法顺利进行，进而影响房屋质量问题的解决。
- 若因鉴定费用问题产生纠纷并提起诉讼，可能需要花费更多的时间和精力来处理法律事务，甚至可能承担不必要的法律费用。
因此，在处理房屋经营性鉴定费用问题时，应综合考虑各种因素，明确责任方，并尽可能通过协商或法律途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。