供货商虚开发票套取医院资金的行为是违法的，具体分析如下：

1. 从发票管理角度
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，任何单位和个人不得为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票（即虚开发票）。供货商若通过虚构交易、伪造合同等方式虚开发票，直接违反该规定，可能面临税务机关的行政处罚，包括罚款、没收违法所得，甚至吊销发票领用资格。

2. 从刑法角度
   若虚开发票行为涉及套取资金数额较大，可能触犯《中华人民共和国刑法》中的多项罪名：

   • 虚开发票罪（第二百零五条之一）：情节严重的，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
     
   • 诈骗罪（第二百六十六条）：若以非法占有为目的，通过虚开发票骗取医院资金，数额较大的，可能构成诈骗罪，最高可处无期徒刑。
     
   • 贪污罪或职务侵占罪（第三百八十二条、第二百七十一条）：若供货商与医院内部人员勾结，利用职务便利套取资金，可能涉及共同犯罪，需根据主体身份区分罪名。

3. 从民事责任角度
   医院作为付款方，若因供货商虚开发票遭受损失（如被税务机关追缴税款、罚款），可依据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，要求供货商承担违约责任，赔偿包括直接损失和可得利益损失在内的全部损失。

4. 对医院的影响
   医院若明知或应知供货商虚开发票仍接受，可能被认定为“善意取得”不成立，需承担补缴税款、滞纳金等责任，甚至面临行政处罚。此外，此类行为可能损害医院声誉，引发医保部门、卫健委等监管机构的调查。

建议：若您或您所在的机构涉及此类情况，请立即停止相关行为，并委托律师对已发生的交易进行合规审查。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律风险及应对方案。