当机动车在交通事故中承担次要责任时，车损的理赔流程通常遵循以下步骤：

一、交强险赔偿

首先，车损赔偿会由对方车辆的交强险在其责任限额内进行赔付。交强险有责财产损失赔偿限额通常为2000元。

• 例如：如果对方车损为5000元，交强险会先赔付2000元，剩余的3000元则按照双方责任比例分担。

二、责任比例分担

若赔偿金额超过了交强险的限额，超出部分将依据事故责任方各自所负的比例进行分担。在机动车承担次要责任的情况下，通常需承担约30%的责任份额（具体比例可能因地区和事故情形有所差异）。

• 继续上例：剩余的3000元中，承担次要责任的一方需支付30%，即900元；而对方则需支付70%，即2100元。

三、商业三者险赔偿

如果涉事车辆还投保了商业三者险，那么超出交强险限额且按照责任比例分担后的损失，会由商业三者险在其责任限额内进行赔付。

• 例如：如果总损失为10万元，交强险赔付2000元后，剩余98000元。若次要责任比例为30%，即需承担29400元。如果商业三者险的责任限额足够，那么这29400元将由商业三者险赔付。

四、注意事项

1. 多车事故：在涉及多车的事故中，责任认定和赔偿份额的计算可能更为复杂。需要综合考虑各方责任、损失情况以及保险情况。
2. 理赔流程与材料：在进行车损理赔时，需按照保险公司的要求提供相关的理赔材料和证明文件。这通常包括事故认定书、维修发票、车辆损失评估报告等。
3. 免责条款：在投保商业险时，应仔细阅读保险合同中的免责条款。某些情况下，保险公司可能不承担赔偿责任或需按照特定比例进行赔付。

综上所述，当机动车在交通事故中承担次要责任时，车损的理赔流程涉及交强险的赔付、责任比例的分担以及商业三者险的赔付（如有投保）。在处理过程中，需密切关注事故责任认定、损失评估以及保险合同的约定，以确保获得合理的赔偿。