办理入职后发现有案底，是否会产生影响需分情况讨论：
一般情况：无直接影响
- 根据我国现行法律，案底（即犯罪记录）本身不会直接导致已入职员工被解雇。用人单位在招聘阶段若未明确要求提供无犯罪记录证明，或未在劳动合同中约定相关限制条款，则员工入职后发现案底通常不构成合法解雇理由。
- 法律依据：《劳动合同法》第三十九条仅规定“被依法追究刑事责任”的劳动者可被解雇，但需满足“在试用期内被证明不符合录用条件”或“严重违反用人单位规章制度”等前提。若案底与当前工作无关联性（如员工曾因酒驾被判刑，但现从事文职工作），用人单位难以直接以此为由解除合同。
特殊情况：可能产生影响
- 职业限制情形：若员工案底涉及《刑法》第一百条规定的“依法受过刑事处罚的人，在入伍、就业时，应当如实向有关单位报告自己曾受过刑事处罚，不得隐瞒”，且其岗位属于法律明确禁止有犯罪记录人员从事的职业（如法官、检察官、警察、律师、会计师等），则用人单位可依法解除劳动合同。
- 用人单位规章制度：若公司规章制度明确规定“有犯罪记录者不得担任特定岗位”（如财务、出纳等涉及资金安全的职位），且该制度已通过民主程序制定并公示，员工入职后被发现案底可能面临调岗或解雇。
- 试用期解除：若员工处于试用期，且案底显示其不符合录用条件（如招聘时明确要求“无犯罪记录”），用人单位可依据《劳动合同法》第三十九条第一项解除合同。
法律建议
- 员工角度：入职时应主动了解岗位是否涉及职业限制，避免隐瞒案底导致后续纠纷。若已入职，可与用人单位协商调整岗位或签订保密协议，降低风险。
- 用人单位角度：招聘时应在岗位说明书中明确职业限制条件，并在劳动合同中约定“员工需如实告知犯罪记录，否则构成欺诈”等条款。发现员工有案底后，应评估其与岗位的关联性，避免违法解雇。
总结：案底对入职后的影响取决于岗位性质、用人单位规定及案底与工作的关联性。若您或用人单位面临此类问题，可直接向我咨询具体应对方案。