您有权通过法律途径要求邻居对化粪池进行整改。以下是从不同角度为您进行的分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。具体来说：
- 第二百八十八条：不动产的相邻权利人应当正确处理相邻关系，这包括尊重对方的合法权益，不得损害对方的正常生活。
- 第二百九十条：不动产权利人应当为相邻权利人用水、排水提供必要的便利。化粪池作为排水设施的一部分，其建设位置应当考虑到对相邻不动产的影响，避免对对方的生活造成实质性冲击。
二、邻居行为分析
邻居将化粪池建在您家卧室窗户两米处，这一行为很可能已经对您的正常生活造成了实质性影响，如产生异味、影响通风和采光等。这种影响不仅违反了相邻关系的处理原则，也可能构成对您相邻权的侵犯。
三、法律建议与行动步骤
友好协商：
- 首先，您可以尝试与邻居进行友好协商，表达您的担忧和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。这可能包括调整化粪池的位置、增加隔音和防臭措施等。
收集证据：
- 如果协商无果，您需要开始收集证据，以证明邻居的行为确实对您的生活造成了实质性影响。这可能包括拍摄照片、录制视频、收集邻居化粪池建设的相关文件或规划图等。
提起相邻权诉讼：
- 在收集到足够证据后，您可以依法向法院提起相邻权诉讼，请求法院判决邻居立即停止侵犯、排除妨碍，并赔偿因其行为而导致的经济损失。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持您的诉求。
寻求法律援助：
- 如果您在法律程序上遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师的法律援助。律师将能够为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地维护自己的合法权益。
四、可能的法律后果
- 如果法院认定邻居的行为确实侵犯了您的相邻权，并对您造成了实质性影响，那么邻居可能需要承担停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等法律责任。
- 在极端情况下，如果邻居的行为构成恶意侵权或故意损害他人财产，还可能面临更严重的法律后果，如罚款、拘留等。
五、注意事项
- 在整个过程中，请保持冷静和理性，避免与邻居发生不必要的冲突和争执。
- 请确保您的行为合法合规，不要采取过激或违法的手段来维护自己的权益。
如果您有任何进一步的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供更详细和专业的法律建议。