在起诉对方公司时，其关联公司的处理方式需结合具体法律关系和案件事实来综合判断，以下是详细分析：

1. 若关联公司构成共同侵权或共同债务人
   根据《民法典》第1168条（二人以上共同实施侵权行为造成他人损害的，应当承担连带责任），若关联公司与被诉公司存在共同实施侵权行为（如共同生产销售侵权产品、共同实施商业欺诈等），或关联公司通过实际控制、资金混同、人员混同等方式与被诉公司构成人格混同（参照《公司法》第20条“法人人格否认”制度），则可主张关联公司承担连带责任。此时需重点收集关联公司参与侵权/违约行为的证据（如合同、转账记录、邮件往来等）。

2. 若关联公司仅为独立法人主体
   若关联公司与被诉公司无直接法律关系（如无共同行为、无财产混同），则原则上不能直接起诉关联公司。但可通过以下途径间接影响关联公司：

   • 申请财产保全：若能证明被诉公司通过关联交易转移财产（如低价转让资产、虚构债务），可依据《民事诉讼法》第103条申请法院冻结关联公司持有的被诉公司股权或应收款项；
     
   • 追加被执行人：在执行阶段，若发现关联公司滥用股东权利导致被诉公司财产减少（如未足额出资、抽逃出资），可依据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》第17-20条申请追加关联公司为被执行人。

3. 特殊情形：母子公司或兄弟公司关系

   • 母公司对子公司的责任：母公司通常不因子公司债务承担责任，但若母公司过度控制子公司导致子公司丧失独立性（如业务、财务、人员完全由母公司决定），可主张“刺破公司面纱”要求母公司担责；
     
   • 兄弟公司间的责任：除非能证明兄弟公司存在共同行为或人格混同，否则一般无法直接追究兄弟公司责任。

操作建议：

• 起诉前通过工商档案、银行流水、合同等证据，分析关联公司与被诉公司的法律关系；
  
• 起诉时将关联公司列为共同被告（若有共同行为或人格混同证据）或第三人（若需查明事实）；
  
• 执行阶段密切关注被诉公司财产变动，及时申请追加关联公司为被执行人。

如有具体案件材料（如合同、转账记录等），可进一步分析关联公司的责任边界。