针对您提出的“公司注销后起诉对方公司怎么处理”的问题，这是一个涉及法律程序和责任归属的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、理解公司注销后的法律状态
公司注销后，其法人资格即告消灭，通常不再具备直接作为诉讼主体的能力。但这并不意味着与公司相关的法律事务就此终结，特别是当存在未了结的债权债务或法律纠纷时。
二、分析起诉的具体原因和责任主体
明确起诉原因：
- 您需要首先弄清楚起诉的具体原因，是因为合同纠纷、债务问题、侵权行为还是其他法律责任。
确定责任承担者：
- 如果公司在注销前未依法进行清算，或者存在恶意逃避债务的行为，那么股东、董事等可能需对公司债务承担连带清偿责任。
- 若公司在注销过程中存在违法行为，如提交虚假材料，相关责任人也可能面临法律责任。
三、针对不同情况的处理方式
公司未经合法清算即办理注销登记：
- 根据相关法律规定，若公司未经依法清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算，债权人可主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。
- 在这种情况下，被起诉的股东或相关人员应积极应诉，提供证据证明自身无过错或不应承担责任。如确实存在责任，可与债权人协商解决方案。
公司提交虚假材料或采取欺诈手段隐瞒重要事实取得注销登记：
- 此类情况下，债权人可请求相关责任人员承担赔偿责任。
- 相关责任人应配合调查，说明真实情况。如因他人行为导致被冒名或误操作，应及时向登记机关申请撤销注销登记，并恢复公司主体资格以应对诉讼。
公司已合法清算并注销：
- 公司经过合法清算程序后注销，其法人资格终止，原则上不再承担民事责任。
- 但若发现清算过程中存在遗漏债务或资产分配不公等问题，债权人可在一定期限内向清算组成员提出索赔请求。清算组成员需证明自身已尽到勤勉尽责义务，否则可能承担赔偿责任。
四、实际操作建议
收集证据：
- 包括公司注销前的财务报表、清算报告、债权债务清单等文件资料。
- 与案件相关的合同协议、往来函件、沟通记录等证据材料。
法律咨询：
- 及时寻求专业律师的帮助，了解自身权利义务及应对策略。
- 律师可根据具体情况制定详细的应诉方案或和解计划。
积极应诉或协商：
- 按照法院要求参加庭审活动，充分阐述观点和理由。
- 在尊重事实和法律的基础上与对方进行协商谈判，争取达成和解协议以减轻损失。
综上所述，公司注销后起诉对方公司的处理需综合考虑多种因素，包括注销前的清算情况、被起诉的具体原因以及是否存在遗漏的债权债务等。在实际操作中，建议您寻求专业律师的帮助以确保合法权益得到有效维护。