二人合伙公司中，仅法定代表人一方不能自行注销公司。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律程序角度

公司注销是涉及众多股东和债权人权益的重要事项，必须遵循严格的法定程序。根据《公司法》的相关规定，公司解散需经股东会作出决议。对于有限责任公司而言，这一决议须经代表三分之二以上表决权的股东通过。在二人合伙的公司中，若另一方股东早已离开且未参与公司事务，但并未通过正式程序退出公司或转让其股权，那么仅法定代表人一方是无权单独作出注销公司决定的。

二、注销步骤角度

若确实需要注销公司，通常需按照以下步骤进行：

1. 依法成立清算组：清算组负责清理公司资产、债权债务等事务。
2. 通知债权人并公告：处理与清算有关的未了结业务，确保债权人的权益得到保障。
3. 清缴税款：包括公司所欠税款及清算过程中产生的税款。
4. 清理债权、债务：确保公司债权债务得到妥善处理。
5. 处理剩余财产：在公司清偿债务后，处理剩余财产。
6. 制作清算报告：完成清算后，制作清算报告并申请注销公司登记。
7. 公告公司终止：注销登记完成后，公告公司终止。

这些步骤中，每一步都需要严格按照法律规定执行，且往往需要股东的共同参与和决策。

三、法律责任角度

若法定代表人擅自注销公司，可能会损害另一股东的利益。在此情况下，另一股东有权通过法律途径追究其责任，并要求赔偿损失。这包括但不限于因擅自注销公司而导致的直接经济损失、商业机会丧失等。

四、实际操作建议

1. 与另一股东协商：尝试与另一股东取得联系，就公司注销事宜进行协商，并达成一致意见。
2. 寻求法律援助：若无法与另一股东取得联系或协商无果，可寻求专业律师的法律援助，通过法律途径解决公司注销问题。
3. 遵循法定程序：在整个注销过程中，务必遵循法定程序，确保每一步都合法合规。

总结与建议：在二人合伙的公司中，仅法定代表人一方不能自行注销公司。若确实需要注销公司，应与另一股东协商并达成一致意见，同时遵循严格的法定程序。若遇到法律难题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。