针对“合同到期双方仍合作怎么办”这一问题，我们可以从法律角度和实际操作层面进行详细分析：
一、法律层面的处理
视为继续履行原合同：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同到期后，如果双方继续按照原合同的条件和条款进行合作，且没有提出异议，那么可以视为双方同意以原条件继续履行合同。这种情况下，原合同的条款和条件仍然对双方具有约束力。
签订新合同或补充协议：
- 为了明确双方的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷，建议双方在合同到期后尽快协商并签订新的合同或补充协议。新合同或补充协议可以明确新的合作期限、合作内容、权利义务等关键条款，为双方的合作提供明确的法律保障。
二、实际操作层面的建议
及时沟通协商：
- 合同到期后，双方应及时进行沟通，明确是否继续合作以及合作的具体条件和条款。通过充分的沟通，可以增进双方的理解和信任，为后续的合作打下良好的基础。
明确合作期限和条件：
- 在签订新合同或补充协议时，双方应明确合作的具体期限和条件。这包括合作的时间、地点、内容、方式、费用等各个方面。明确的合作期限和条件有助于双方更好地规划合作进程，避免未来可能出现的纠纷。
保留相关证据：
- 在合同到期后继续合作的过程中，双方应保留好与合作相关的证据，如合同文本、往来邮件、聊天记录、付款凭证等。这些证据在未来可能出现的纠纷中具有重要的证明作用，有助于维护双方的合法权益。
三、可能面临的法律后果及应对策略
如果一方希望终止合作：
- 如果一方在合同到期后希望终止合作，应提前与对方进行沟通，并按照合同约定或法律规定的方式通知对方。同时，应妥善处理合作期间的债权债务等善后事宜，避免给对方造成不必要的损失。
如果双方对合作条件有争议：
- 如果双方在合同到期后对合作条件有争议，应首先通过友好协商的方式解决。如果协商不成，可以寻求第三方调解或仲裁机构的帮助。在必要时，也可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径解决争议。
总结与建议：合同到期后双方仍继续合作时，从法律层面讲，可以视为继续履行原合同或签订新合同/补充协议；从实际操作层面讲，建议双方及时沟通协商、明确合作期限和条件，并保留好相关证据。如果一方希望终止合作或双方对合作条件有争议，应按照合同约定或法律规定的方式处理。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。