未入住酒店退款扣款是否合法，需根据具体情况判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、法律层面分析
《中华人民共和国民法典》相关规定
- 根据《民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。在酒店预订的情境中，如果顾客因自身原因未能按时入住且未提前通知酒店取消或变更预订，可能构成违约行为，酒店有权根据合同约定扣除一定费用作为违约金。
- 同时，根据《民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。但约定的违约金不得过分高于造成的损失，否则人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
《中华人民共和国消费者权益保护法》相关规定
- 根据《消费者权益保护法》第四条，经营者与消费者进行交易应遵循自愿、平等、公平、诚实信用的原则。酒店不得设置不合理退款条款侵害消费者权益。
- 同时，根据《消费者权益保护法》第二十六条，经营者不得以格式条款等方式排除或限制消费者权利。例如，不可单方面规定“预订后不可取消”等霸王条款。如果酒店存在此类条款，可能被视为无效。
二、合同层面分析
- 酒店与顾客之间的预订关系通常被视为一种合同关系。在预订时，双方应明确约定退款政策、取消条款等内容。如果顾客在预订时同意了酒店的退款政策（如“不可取消”或“限时取消”），则酒店有权按照约定执行扣款。但扣款金额应合理，不得过高。
三、实际操作建议
查看合同条款：
- 在预订酒店前，务必仔细阅读合同条款，特别是关于退款政策的部分。了解酒店对于未入住情况下的扣款规定。
了解行业惯例：
- 多数酒店允许在入住前一定时间内免费取消（通常为24-72小时），但具体规则因酒店而异。部分平台（如Booking、携程）提供“免费取消保障”，需提前确认条款。
协商处理：
- 如果因特殊原因（如突发疾病、家庭变故等）无法入住，且合同中没有明确规定扣款金额或扣款比例过高，可以尝试与酒店协商，看是否可以减少扣款或全额退款。
寻求法律援助：
- 如果与酒店协商无果，且认为酒店的扣款行为违反了法律规定或合同约定，可以向当地的消费者权益保护机构或律师咨询，寻求专业的帮助和支持。
四、特殊情况下的处理
不可抗力：
- 因自然灾害、疫情等不可抗力因素导致无法入住的，消费者应及时通知酒店并提供证明，通常可全额退款。
酒店过错：
- 若酒店未能提供服务（如超售、设施故障等），消费者有权要求全额退款并索赔。
总结与建议：未入住酒店退款扣款是否合法，需根据合同约定、法律规定以及实际情况进行综合判断。在预订酒店时，建议消费者仔细阅读合同条款，了解退款政策，并在必要时与酒店协商或寻求法律援助。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。