诊所不用商业用房是否合法，需结合具体情况及当地法规来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 法规层面

• 商业用房定义：商业用房通常指用于商业经营活动的房屋，如商铺、写字楼等。其规划用途、产权性质等需符合相关法规要求。
• 诊所设置要求：根据《医疗机构管理条例》及其实施细则，诊所的设置需满足一定的场所条件，包括但不限于房屋用途、面积、布局等。若当地法规明确规定诊所必须使用商业用房，则非商业用房可能不符合要求。
• 地方性法规：不同地区可能对诊所的设置场所有具体规定。例如，某些城市可能要求诊所必须位于商业区或特定医疗区域内，而另一些地区则可能允许在住宅区或混合用途区内设置诊所。

2. 实际操作层面

• 产权性质：即使房屋规划用途为非商业用房，若产权人同意并办理相关变更手续（如将住宅改为商用），且符合当地规划、消防等要求，可能可用于诊所经营。但此过程需经过严格审批，且可能面临邻里反对等风险。
• 租赁合同：若诊所通过租赁方式使用房屋，需确保租赁合同中明确房屋用途为诊所经营，且出租方有权出租该房屋用于此目的。否则，可能因合同无效或违约而面临法律风险。
• 消防与安全：无论房屋性质如何，诊所均需满足消防安全要求。若非商业用房在消防设施、疏散通道等方面存在缺陷，可能无法通过消防验收，从而影响诊所合法经营。

3. 法律后果

• 行政处罚：若诊所未按照法规要求使用商业用房，可能面临卫生行政部门、规划部门等的行政处罚，包括罚款、责令停业整顿等。
• 民事纠纷：若因房屋用途问题引发与出租方、邻里等的民事纠纷，诊所可能需承担违约责任或侵权责任。
• 刑事责任：在极端情况下，若诊所因房屋用途问题导致严重后果（如火灾、人员伤亡等），相关责任人可能面临刑事责任。

建议

• 核查当地法规：在设置诊所前，务必核查当地关于医疗机构设置场所的具体规定，确保符合要求。
• 咨询相关部门：向当地卫生行政部门、规划部门等咨询诊所设置场所的具体要求及审批流程。
• 完善法律手续：确保房屋产权清晰、租赁合同合法有效，并办理相关变更手续（如需）。
• 注重消防安全：无论房屋性质如何，均需确保诊所满足消防安全要求，避免安全隐患。

如有具体法律问题或需进一步了解当地法规要求，可直接向我咨询。