针对您提出的“如双方已签有婚内财产约定，原告可以申请调查被告银行帐户及流水吗”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，需要明确的是，婚内财产协议主要聚焦于夫妻财产的归属、分配和掌控等事宜。这份协议的存在，并不直接阻碍一方去查询另一方的银行流水。关键在于，查询行为是否具备合法合理的事由，并且是否遵循了法律所规定的程序。

在特定情况下，如怀疑对方存在隐匿、转移夫妻共同财产等损害自身权益的行为时，原告是有权利向法院提出申请，要求查询被告的银行流水以及其他财产信息的。这种申请通常需要在诉讼程序中提出，并且需要向法院提交书面申请，详细说明需要查询流水的原因、涉及的案件事实以及明确的银行账户信息等。

法院在收到申请后，会根据具体案件情况和合理性进行审查判断。如果法院认为申请合理且必要，会签发调查令，允许原告持令前往相关银行进行查询。但需要注意的是，查询过程必须严格遵循法律所规定的各项要求和程序，绝对不可以随意侵犯他人的隐私。

另外，如果被告自愿配合，也可以让其携带身份证、银行卡到银行网点，按银行要求的流程进行查询打印，或者通过网上银行等方式获取流水信息后提供给原告。但这种方式需要被告的明确同意和配合。

最后，需要强调的是，未经法定程序或对方同意，私自通过不正当手段查询对方银行流水，可能涉嫌侵犯个人隐私或违反相关规定。这种行为不仅不被法律允许，而且所获取的信息在诉讼中也可能不被认可。

综上所述，虽然双方已签有婚内财产约定，但原告在具备合法合理事由且遵循法律程序的情况下，是可以向法院申请调查被告银行帐户及流水的。