对方欠五千元只还了三千元，债权人仍有权起诉，且若符合起诉条件，法院会受理案件。以下从不同角度为您详细分析：

债权人角度

1. 起诉权不受影响：债权人认为自身权益受损，即便债务人已偿还部分款项，仍有权向法院提起诉讼。这是法律赋予债权人的基本权利，旨在保障其合法权益不受侵害。例如，小许向小李借款五千元，后偿还三千元，尚欠两千元未还。小李认为自身权益受损，即便小许已还部分款项，仍决定向法院起诉小许，要求其偿还剩余欠款。
2. 起诉条件：债权人起诉需满足一定条件，包括与案件有直接利害关系、有明确被告、有具体诉讼请求和事实理由、属于法院受理民事诉讼范围和受诉法院管辖。在上述例子中，小李与本案有直接利害关系，被告小许明确，小李有要求小许偿还剩余两千元欠款的具体诉讼请求及小许借款未还清的事实理由，且该案件属于法院受理民事诉讼范围和受诉法院管辖，因此法院会受理。

债务人角度

1. 积极应对诉讼：若被起诉，债务人应积极应对，在法庭上说明还款情况并提供相应证据。这有助于法院全面了解案件事实，作出公正判决。例如，小许得知被起诉后，可在法庭上表明自己已偿还三千元的情况，并提供转账记录等还款证据。
2. 争取调解和制定还款计划：债务人可争取与债权人达成调解，制定合理还款计划。这既能解决纠纷，又能维护双方关系。在法庭上，小许可与小李协商，制定一个双方都能接受的还款计划，如分期偿还剩余欠款。

法律程序角度

1. 立案准备：债权人向法院提起诉讼时，需准备好能证明借贷关系存在的证据，如借条、转账记录等，同时书写好包含原被告信息、诉讼请求、事实和理由等内容的民事起诉状。这些材料是法院受理案件的重要依据。
2. 法院受理：符合起诉条件的，法院会受理案件。受理后，法院会依法进行审理，并根据案件事实和法律规定作出判决。若债务不合法，如因赌博产生，法院一般不会立案受理。因此，判断债务是否合法是关键，需进一步审查相关证据。

给您的小建议：

• 若您是债权人，在决定起诉前，可再次与债务人沟通，尝试通过协商解决问题。若协商无果，再考虑通过法律途径维护自身权益。
• 若您是债务人，在收到起诉状后，不要忽视或逃避，应积极应对诉讼，与债权人协商解决方案。

在处理此类纠纷时，务必保留好相关证据，如借条、转账记录、聊天记录等。这些证据在诉讼中至关重要，能为您的权益提供有力保障。如果您还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。