挪用的资金单位不起诉或者和解，并不直接决定司法机关是否起诉，但单位的态度和后续行为会影响案件走向，具体需分情况讨论：

一、单位不起诉或和解的直接影响

1. 单位作为被害方的权利
   单位发现员工挪用资金后，可依据内部规章制度决定是否追究民事责任（如要求赔偿损失、开除员工），或向公安机关报案。但单位无权决定是否启动刑事程序，刑事追责权属于司法机关（检察院、法院）。

2. 和解的效力
   若单位与员工达成和解（如员工归还资金、赔偿损失），单位可出具《谅解书》。该文件在刑事程序中可能作为从轻情节（如减少刑期、适用缓刑），但无法直接导致刑事程序终止。司法机关仍需独立审查案件是否构成犯罪、是否需追究刑责。

二、司法机关是否起诉的核心标准

根据《刑法》第二百七十二条及司法实践，司法机关决定是否起诉挪用资金罪，主要考虑以下因素：

1. 法定不起诉情形

若案件存在以下情形，检察院必须不起诉：

• 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪；
• 犯罪已过追诉时效期限；
• 经特赦令免除刑罚；
• 犯罪嫌疑人死亡。

示例：员工挪用资金5000元用于个人消费，3日内归还，未造成损失，且无其他恶劣情节，可能被认定为“情节显著轻微”，检察院可不起诉。

2. 酌定不起诉情形

若犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或可免除刑罚，检察院可以不起诉。常见情形包括：

• 挪用资金数额较小（如刚达立案标准）；
• 案发后及时归还全部资金；
• 取得单位谅解；
• 存在自首、立功等情节。

示例：员工挪用资金10万元用于投资，1个月后归还，单位出具谅解书，且员工有自首情节，检察院可能决定不起诉。

3. 证据不足不起诉

若案件经二次补充侦查后，检察院仍认为证据不足、不符合起诉条件，应当不起诉。

示例：员工挪用资金后销毁账目，现有证据仅能证明资金异常流动，无法直接指向员工，检察院可能因证据不足不起诉。

4. 必须起诉的情形

若挪用资金数额巨大（如超过100万元）、进行非法活动（如赌博、贩毒），或拒不归还资金，即使单位不追究，司法机关也会依法起诉并追究刑责。

示例：员工挪用资金200万元用于赌博，案发后未归还，单位虽表示不追究，但司法机关仍会以挪用资金罪起诉，可能判处3年以上10年以下有期徒刑。

三、实务建议

1. 对员工而言：

   • 挪用资金后应立即归还，争取单位谅解；
   • 主动向公安机关自首，争取从轻处理；
   • 保留还款凭证、谅解书等证据，以备司法审查。

2. 对单位而言：

   • 发现挪用行为后，应及时固定证据（如账目、转账记录）；
   • 决定是否报案需综合考量：若金额小、情节轻，可内部处理；若金额大、性质恶劣，应报案并配合调查；
   • 出具谅解书需谨慎，避免被认定为“包庇犯罪”。

结论：单位不起诉或和解无法直接阻断刑事程序，但可能通过影响犯罪情节认定（如从轻、减轻处罚）间接影响案件结果。是否起诉最终由司法机关根据犯罪事实、证据及法律规定独立决定。如有具体案件，可进一步提供细节，我将结合案情分析。