在施工方与建设方签订的施工合同中约定部分参照招标文件的情况下，合同效力通常大于招标文件，但具体还需根据合同条款的明确性、双方的真实意思表示以及相关法律法规进行综合判断。以下从不同角度进行详细分析：

1. 合同效力优先原则

• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。这意味着，一旦施工合同成立并生效，其条款即对双方具有法律约束力，应优先于招标文件执行。
• 实践应用：在实际操作中，如果施工合同中明确约定了部分条款参照招标文件，但同时又对招标文件中的某些内容进行了修改或补充，那么应以施工合同中的约定为准。因为合同是双方协商一致的结果，体现了双方的真实意思表示。

2. 招标文件的参考作用

• 招标文件的性质：招标文件是招标人向潜在投标人发出的邀请，用于说明招标项目的需求、条件、评标标准等。它本身并不具有法律约束力，除非被合同明确引用并成为合同的一部分。
• 合同中的引用：如果施工合同中明确约定了“部分参照招标文件”，那么招标文件中的相关内容应被视为合同的一部分，对双方具有约束力。但这种约束力来源于合同的引用，而非招标文件本身的法律效力。

3. 特殊情况下的处理

• 合同条款不明确：如果施工合同中关于参照招标文件的条款表述模糊或存在歧义，可能导致双方对合同内容产生争议。在这种情况下，应依据《民法典》中关于合同解释的规定，结合双方的真实意思表示、交易习惯以及诚信原则进行解释。
• 法律法规的强制性规定：如果招标文件或施工合同中的某些条款违反了法律法规的强制性规定，那么这些条款将被视为无效。在这种情况下，应依据相关法律法规进行处理，而非简单地依据合同或招标文件的约定。

4. 法律建议

• 明确合同条款：为避免争议，建议在施工合同中明确约定参照招标文件的具体范围、方式以及修改或补充的内容。这样可以使合同条款更加清晰、明确，减少双方之间的误解和争议。
• 保留相关证据：在合同履行过程中，双方应妥善保管与合同相关的证据材料，如招标文件、施工合同、往来函件等。这些证据材料在发生争议时可能起到关键作用。
• 及时咨询专业律师：如果双方在合同履行过程中发生争议，且无法通过协商解决，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，帮助双方维护自身合法权益。