不同意工程款抵房款的理由可围绕合同约定、法律风险、经济合理性及实际履行障碍等角度撰写，具体如下：

1. 合同约定与意思自治原则
   若双方签订的工程合同中未明确约定“以房抵款”的支付方式，或仅约定货币支付义务，则承包方有权拒绝非货币形式的履行。根据《民法典》第五百一十一条，当事人对价款支付方式约定不明确的，应按照有利于实现合同目的的方式履行，通常以货币支付为原则。若合同已明确约定工程款支付方式（如银行转账），则发包方单方变更支付方式构成违约。

2. 法律风险与权利限制
   以房抵款可能涉及房屋产权瑕疵、抵押查封、过户障碍等风险。例如，若抵债房屋未取得预售许可证、存在共有权人争议或已被司法查封，则承包方无法实现物权转移，导致债权落空。此外，若房屋价值显著低于工程款金额，可能构成显失公平，承包方有权依据《民法典》第一百五十一条主张撤销。

3. 经济合理性与市场价值
   若抵债房屋的市场价格远低于工程款金额，或房屋位置偏远、流动性差，承包方接受抵房将面临资产贬值风险。此时，可主张以房抵款不符合等价有偿原则，要求发包方按市场价补足差价或直接支付货币。

4. 实际履行障碍
   若发包方提供的房屋存在规划违规、无法办理产权证等情形，或承包方不具备购房资格（如限购政策），则合同目的无法实现。根据《民法典》第五百六十三条，当事人一方迟延履行债务或有其他违约行为致使不能实现合同目的，另一方有权解除合同。

撰写建议：

• 引用具体合同条款，说明双方权利义务；
  
• 附房屋产权证明、评估报告等证据，证明抵房方案的不合理性；
  
• 明确要求发包方限期支付货币工程款，并保留追究违约责任的权利。
  

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