公司违约金核算的责任归属，并非绝对由行政部门负责，而是取决于公司内部职责划分、合同约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 公司内部职责划分角度

• 一般原则：在公司内部，违约金的核算可能涉及多个部门，如财务部门、法务部门或业务部门。具体由哪个部门负责，通常取决于公司内部的职责划分和流程设计。
• 行政部门角色：如果公司内部规定行政部门负责合同管理、执行监督及违约处理等事务，那么行政部门可能会在一定程度上参与违约金的核算工作。但这并不意味着行政部门是唯一或主要的责任方。
• 多部门协作：在实际操作中，违约金的核算往往需要财务部门提供数据支持，法务部门提供法律意见，业务部门提供合同执行情况等信息。因此，更可能是多部门协作完成。

2. 合同约定角度

• 合同条款：违约金的核算责任可能直接在合同中明确约定。例如，合同可能规定由违约方承担核算责任，或者指定某个部门（如财务部门）负责核算。
• 遵循合同：在这种情况下，公司应遵循合同约定来确定违约金的核算责任。如果合同没有明确规定，则需要根据公司内部规定和行业惯例来判断。

3. 法律法规角度

• 法律依据：违约金的核算应遵循相关法律法规的规定，如《中华人民共和国民法典》中关于违约金的规定。这些法律法规主要规定了违约金的计算方式、上限等，但并未直接规定由哪个部门负责核算。
• 合规性要求：无论由哪个部门负责核算，都应确保核算过程的合规性，避免违反法律法规的规定。

法律建议

• 明确职责：公司应明确各部门在违约金核算中的职责和分工，避免出现责任不清、推诿扯皮的情况。
• 完善合同：在签订合同时，应尽可能明确违约金的核算责任、计算方式等条款，以减少后续争议。
• 加强协作：违约金的核算往往涉及多个部门，因此应加强部门间的沟通和协作，确保核算工作的顺利进行。
• 寻求法律意见：在涉及复杂或高额的违约金核算时，建议公司寻求专业法律意见，以确保核算结果的合法性和准确性。

若您在公司违约金核算方面遇到具体问题或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。