结论：若拿了公司三箱水后又放回，一般处罚可能较轻或无实质处罚，但具体需结合公司规章制度、行为性质及后果等因素判断。以下从不同角度分析：

1. 公司规章制度角度
   公司通常会在员工手册或规章制度中明确对“擅自拿取公司财物”行为的处罚规定。若制度中规定“拿取后归还可免于处罚”，则可能无实质处罚；若规定“无论是否归还均需处罚”，则可能面临警告、扣减绩效等。但实践中，多数公司会考虑“归还”这一情节，从轻处理。

2. 行为性质与后果角度

   • 无恶意或情节轻微：若您因疏忽或临时需求拿取，且及时归还，未造成公司损失或影响，公司可能仅口头提醒或不予处罚。
     
   • 存在恶意或反复行为：若您多次拿取或拿取时存在故意（如私用、转卖意图），即使归还，公司也可能依据制度给予警告、记过甚至解除劳动合同。
     
   • 造成实际损失：若拿取行为导致公司财物损坏或影响正常运营（如急需用水时被拿走），即使归还，公司也可能要求赔偿损失或给予更重处罚。

3. 法律风险角度
   从法律层面，若拿取行为未达到“职务侵占罪”或“盗窃罪”的构成要件（如金额未达刑事立案标准），则一般不涉及刑事责任。但若公司以此为由解除劳动合同，需符合《劳动合同法》中“严重违反规章制度”的情形，否则可能构成违法解除。

建议：

• 主动向公司说明情况，强调“已及时归还”及无恶意，争取从轻处理。
  
• 查阅公司规章制度，了解对类似行为的具体规定。
  
• 若公司处罚过重（如解除合同），可要求公司出具书面处罚依据，并咨询法律意见。
  

如有进一步疑问，可直接向我提问，我会结合具体细节为您分析。