员工因为合同诈骗导致取保候审，退还保证金后，是否会有案底，取决于案件的最终处理结果。以下是对此问题的详细分析：

1. 取保候审与案底的关系：

   • 取保候审是刑事诉讼中的一种强制措施，它本身并不直接决定是否会有案底。案底，通常指的是犯罪记录，即一个人因犯罪行为被法院判处有罪后留下的记录。
   • 取保候审期间，如果案件最终被撤销、不起诉或者判决无罪，那么通常不会留下案底。但如果案件最终被法院判决有罪，那么就会留下案底。

2. 退还保证金的意义：

   • 退还保证金通常意味着取保候审的解除，或者是因为被取保候审人遵守了取保候审的规定，没有违反法律或相关程序。但这并不直接决定案件的最终结果，也不直接决定是否会有案底。
   • 保证金的退还与案件是否会有案底是两个独立的问题。保证金的退还更多是关于取保候审程序的履行情况，而案底则与案件的最终法律后果有关。

3. 合同诈骗案件的可能结果：

   • 在合同诈骗案件中，如果员工被指控但最终被法院判决无罪，或者案件被撤销、不起诉，那么不会留下案底。
   • 如果员工被法院判决有罪，那么就会留下案底，无论是否曾经取保候审或退还保证金。

4. 建议与后续行动：

   • 如果员工目前处于取保候审阶段，并且担心是否会有案底，建议积极配合调查，遵守取保候审的规定，并寻求专业律师的帮助以了解案件进展和可能的法律后果。
   • 如果案件最终进入审判阶段，员工应做好应诉准备，包括收集证据、准备辩护材料等。
   • 无论案件结果如何，员工都应了解自己的法律权利和义务，并在必要时寻求法律援助。

总结来说，员工因为合同诈骗导致取保候审并退还保证金后，是否会有案底取决于案件的最终处理结果。如果案件最终被撤销、不起诉或者判决无罪，那么通常不会留下案底；如果被判决有罪，则会留下案底。因此，建议员工密切关注案件进展，并在必要时寻求专业律师的帮助。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。