结论前置：税务稽查局查处案件时间过长是否属于程序违法，需结合具体法律规定和案件情况综合判断，不能一概而论。以下分情况说明：

1. 法定办案期限的约束

根据《税务稽查案件办理程序规定》（国家税务总局令第52号），税务稽查案件的办理期限一般为60日，经批准可延长30日；案情复杂需进一步延长的，需报省级税务局批准。若稽查局未在法定期限内结案，且未履行法定延期手续，则属于程序违法。

关键点：

• 需核实案件是否已超过法定最长期限（通常为90日，特殊情况需省级批准）；
• 若未履行延期报批手续，即使实际办案时间合理，也可能因程序瑕疵被认定为违法。

2. “合理期限”的司法审查标准

即使未超过法定最长期限，若稽查局存在故意拖延或无正当理由长期不作为，可能被法院认定为违反“合理期限”原则。例如：

• 案件事实清楚、证据充分，但稽查局长期不作出处理决定；
• 纳税人多次催告后，稽查局仍不推进程序。

法律依据：

• 《行政诉讼法》第47条：公民申请行政机关履行保护人身权、财产权等合法权益的法定职责，行政机关在接到申请之日起两个月内不履行的，公民可起诉；
• 司法实践中，法院可能结合案件复杂程度、行政效率要求等，综合判断期限是否合理。

3. 例外情形：中止、终止或复杂案件

若稽查局因以下原因暂停办案，且已依法告知纳税人，则不属于程序违法：

• 需等待其他部门协助调查（如公安、银行）；
• 纳税人下落不明或拒不配合；
• 案件涉及重大税款或复杂财务问题，需延长调查时间。

关键证据：

• 稽查局需提供《税务稽查工作底稿》《中止检查审批表》等材料，证明程序合法性。

4. 纳税人的救济途径

若认为稽查局超期办案，纳税人可采取以下措施：

1. 向上一级税务机关申请行政复议，要求确认程序违法并督促结案；
2. 直接向法院提起行政诉讼，请求撤销超期作出的行政行为或确认程序违法；
3. 通过信访、12366纳税服务热线等渠道投诉，要求税务机关说明理由。

提示：实践中，法院对程序违法的认定较为严格，需纳税人提供充分证据证明稽查局存在故意拖延或违反法定程序的行为。

总结建议

• 核实法定期限：先确认案件是否已超过《税务稽查案件办理程序规定》的最长期限；
• 收集拖延证据：如催告记录、稽查局回复等，证明其未履行法定职责；
• 及时维权：若超期且无合法理由，可通过复议或诉讼途径主张权利。

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合案情提供针对性分析。