在立案后，若纪委监委遇到不配合的证人，可以采取以下措施：

1. 法律教育与劝导：

   • 纪委监委工作人员首先会对不配合的证人进行法律教育，明确告知其作为证人的义务和责任，以及不配合可能带来的法律后果。通过劝导，希望证人能够认识到配合调查的重要性，并主动提供证言。

2. 采取强制措施（在符合法定条件时）：

   • 若证人经劝导后仍不配合，且其行为可能构成妨碍作证等违法行为时，纪委监委可以依据相关法律法规，如《中华人民共和国刑事诉讼法》或相关纪检监察规定，对证人采取必要的强制措施。但需注意，强制措施的采取必须严格遵循法定程序和条件，确保不侵犯证人的合法权益。
   • 具体来说，如果证人的不配合行为严重干扰了案件的调查，且符合法律规定的强制措施适用条件（如证人拒不出庭作证且情节严重），纪委监委可以依法向有关机关提出申请，对证人采取如拘传等强制措施。但这一步骤需谨慎操作，确保所有程序均合法合规。

3. 利用其他证据或线索：

   • 在证人不配合的情况下，纪委监委可以积极寻找和利用其他证据或线索来推进案件的调查。这包括但不限于收集物证、书证、电子数据等其他类型的证据，以及通过其他证人或途径获取相关信息。

4. 申请法院协助：

   • 若证人的不配合行为严重影响了案件的审理进程，且纪委监委认为有必要通过法律手段强制证人出庭作证时，可以向法院提出申请，请求法院协助强制证人出庭。法院在审查申请后，若认为符合法律规定，会依法作出相应的裁定或决定。

在处理不配合证人的问题时，纪委监委还需注意以下几点：

• 确保证人权利：在采取任何措施时，都必须确保证人的合法权益不受侵犯。这包括证人的隐私权、人身安全权等。纪委监委应严格遵守法律法规，不得采取非法手段逼迫或威胁证人作证。
• 程序合法合规：所有措施的采取都必须严格遵循法定程序和条件。纪委监委在处理不配合证人的问题时，应确保所有步骤均合法合规，避免因程序瑕疵而导致证据无效或案件处理不当。
• 保持沟通与协调：在处理不配合证人的问题时，纪委监委应与证人保持沟通与协调。通过耐心解释和劝导，尽量争取证人的配合。同时，也可以与证人的家属或相关单位进行沟通，共同做通证人的思想工作。

若您遇到纪委监委在处理不配合证人问题时存在违法行为或不当操作的情况，您可以及时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。