在工程经层层分包的情况下，工地施工人员与用工主体之间的法律关系认定，主要依据是否存在违法分包以及用工主体资格等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、违法分包下的法律关系认定
违法分包的定义：
- 根据相关法律法规，施工单位违反建筑法等法律、行政法规的强制性规定，将承包业务转包、违法分包给不具备用工主体资格的组织或自然人，即构成违法分包。
法律关系认定：
- 在违法分包的情况下，实际施工人（即不具备用工主体资格的组织或自然人）招用的劳动者，与具有用工主体资格的建设单位或施工单位之间，并不直接构成劳动关系。
- 劳动者与实际施工人之间的用工关系，通常按照劳务关系处理。这意味着，劳动者与实际施工人之间形成的是一种基于劳务提供的合同关系，而非劳动关系。
用工主体责任：
- 尽管劳动者与具有用工主体资格的单位之间不构成劳动关系，但根据法律规定，具有用工主体资格的单位仍需承担一定的用工主体责任。例如，当劳动者从事工程承包业务时因工伤亡，或者实际施工人欠付劳动者工资报酬时，具有用工主体资格的单位需承担相应的责任。
二、合法分包下的法律关系认定
合法分包的定义：
- 合法分包是指施工单位在符合法律法规规定的情况下，将部分工程分包给具有相应资质和用工主体资格的组织或个人进行施工。
法律关系认定：
- 在合法分包的情况下，如果劳动者是与具有用工主体资格的分包单位直接签订劳动合同的，那么劳动者与分包单位之间构成劳动关系。
- 如果劳动者并未与分包单位签订劳动合同，但实际为分包单位提供劳务，并接受分包单位的管理和支付报酬，那么根据相关法律法规和司法实践，在特定条件下也可能被认定为存在事实劳动关系。不过，这通常需要劳动者提供充分的证据来证明其与分包单位之间存在实际的用工关系。
三、实务建议
签订书面劳动合同：
- 对于劳动者而言，为了避免法律纠纷和保障自身权益，应尽可能与用工主体签订书面劳动合同。劳动合同是证明劳动关系存在的重要证据，也是劳动者维护自身权益的法律依据。
保留相关证据：
- 如果未能签订书面劳动合同，劳动者应保留与用工主体相关的证据，如工资支付凭证、工作证、服务证、招工招聘登记表、报名表、考勤记录以及其他劳动者的证言等。这些证据在发生法律纠纷时，可以作为证明劳动关系存在的依据。
及时咨询与维权：
- 如果劳动者在工程分包过程中遇到法律纠纷或权益受损的情况，应及时向我这样的专业律师咨询，以便了解自身权益和维权途径。同时，劳动者也可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自身权益。
举例说明：假设一个工程项目由总承包单位承包后，违法分包给了一个不具备用工主体资格的个人。该个人又招用了多名劳动者进行施工。在这种情况下，劳动者与总承包单位之间并不直接构成劳动关系，而是与实际施工人（即不具备用工主体资格的个人）之间形成劳务关系。然而，如果劳动者在施工过程中因工伤亡或未获得工资报酬，总承包单位仍需承担相应的用工主体责任。
综上所述，工程经层层分包时，工地施工人员与用工主体之间的法律关系认定需根据是否存在违法分包以及用工主体资格等因素进行综合判断。