工程签证是否需要甲方公司上会，并没有一个统一的、绝对的答案，这主要取决于甲方公司的内部管理规定、工程签证的性质与金额，以及双方合同中的具体约定。以下是对这一问题的详细分析：
一、甲方公司内部管理规定
公司制度：不同的甲方公司可能有不同的内部管理规定。一些公司可能规定，对于较大金额或重要性的工程签证，需要经过公司内部的会议（如董事会、总经理办公会等）审议通过。而另一些公司则可能将这一决策权下放给项目部门或相关负责人。
审批流程：即使需要上会，不同公司的审批流程也可能不同。有些公司可能要求先由项目部门初步审核，再提交给上级部门或会议审议；而有些公司则可能直接由会议进行审议。
二、工程签证的性质与金额
签证性质：工程签证可能涉及设计变更、工程量增减、材料替换等多种情况。对于一些常规的、小额的签证，甲方公司可能不需要上会审议；而对于一些重大的、可能影响工程整体进度或成本的签证，则可能需要上会。
签证金额：签证金额的大小也是决定是否需要上会的重要因素。一般来说，金额较大的签证更有可能需要经过公司内部的会议审议。
三、双方合同中的具体约定
合同条款：在签订工程合同时，双方可以就工程签证的审批流程进行明确约定。如果合同中规定了工程签证需要经过甲方公司上会审议，那么双方就应当按照合同约定执行。
变更管理：合同中还可能对工程变更的管理进行规定，包括变更的提出、审核、批准等流程。这些规定也可能间接影响工程签证是否需要上会。
法律建议
查阅合同：首先，建议查阅双方签订的工程合同，了解其中关于工程签证审批流程的具体约定。
了解公司制度：其次，可以了解甲方公司的内部管理规定，特别是关于工程签证审批的部分。
沟通协商：如果合同或公司制度中没有明确规定，或者规定存在模糊之处，建议与甲方公司进行沟通协商，明确工程签证的审批流程。
保留证据：在处理工程签证时，建议保留好相关证据，如签证单、审批文件、会议纪要等，以备不时之需。