在职员工起诉公司并不违法，但具体是否合法需视起诉的原因和程序而定。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合法起诉的情形

• 权益受损时的维权：如果公司存在拖欠工资、未依法缴纳社保、违法解除劳动合同等侵害员工权益的行为，员工有权通过法律途径维护自身权益。这种情况下，起诉是依法行使诉讼权利的行为，完全合法。
• 程序要求：通常劳动纠纷需先经过劳动仲裁前置程序，对仲裁结果不服的，可在规定时间内向法院起诉。起诉时，员工需准备好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自身主张。法院会依据事实和法律进行审理并作出判决。

2. 可能违法的情形

• 恶意滥用诉权：如果员工并无合理依据，只是恶意频繁起诉，意图扰乱公司正常经营秩序，这种行为可能涉嫌滥用诉权。滥用诉权不仅会浪费司法资源，还可能给公司造成不必要的损失。在此情况下，该行为可能被认定为违法，公司可依法要求员工承担相应法律责任，如赔偿因诉讼给公司带来的经济损失等。

3. 法律建议

• 合理维权：如果您认为公司存在侵害您权益的行为，建议先通过与公司协商、申请劳动仲裁等合法途径解决纠纷。如果对仲裁结果不服，再依法向法院起诉。
• 避免恶意诉讼：起诉前请确保您的诉求有合理依据，避免恶意诉讼。恶意诉讼不仅可能面临法律责任，还会影响您的个人信誉。
• 咨询专业律师：在起诉前，建议您咨询专业律师，了解您的权益和可能的法律后果，以便更好地维护自身权益。

4. 实际案例

• 案例一：某员工因公司长期拖欠工资，多次协商无果后，依法向劳动仲裁委员会申请仲裁，并对仲裁结果不服向法院起诉。最终，法院判决公司支付拖欠的工资及经济补偿。这是合法维权的典型案例。
• 案例二：某员工因个人不满，无合理依据多次起诉公司，意图扰乱公司经营。法院经审理认为，该员工的行为构成滥用诉权，判决其承担公司因诉讼产生的合理费用。这是恶意诉讼的反面案例。

总结：在职员工起诉公司并不违法，但需确保起诉有合理依据并遵循法定程序。如果您有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。