两家单位共用变压器，且双方不是租赁关系的情况下，能否开具分割单，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、分割单开具的法律依据与原则
分割单通常用于在多个主体共同承担某项费用时，对费用进行分摊的凭证。在财务和税务处理上，分割单需要满足一定的条件，如真实性、合法性、关联性等，以确保其能够作为有效的财务或税务凭证。然而，法律并未明确规定非租赁关系下共用设施的费用分摊必须或可以开具分割单，这主要取决于双方的具体约定以及相关行业或地区的惯例。
二、非租赁关系下的费用分摊
双方约定：
- 如果两家单位在共用变压器时，已经就费用的分摊方式达成了明确的书面或口头协议，并且该协议不违反法律法规的强制性规定，那么双方可以按照协议约定的方式进行费用分摊，并据此开具分割单。
- 协议内容应包括但不限于：变压器的使用方式、费用的分摊比例、分割单的开具与使用等。
无明确约定时的处理：
- 如果双方没有就费用的分摊方式达成明确约定，那么在实际操作中，可能会引发争议。
- 在此情况下，双方可以协商确定费用的分摊方式，并签订补充协议。如果协商不成，可能需要通过法律途径解决争议，如诉讼或仲裁。
- 在争议解决前，双方可能无法直接开具分割单，因为分割单的开具需要基于双方共同认可的费用分摊方式。
三、实际操作中的建议
明确约定：
- 为了避免后续争议，建议两家单位在共用变压器前，就费用的分摊方式、分割单的开具与使用等事项进行明确约定，并签订书面协议。
咨询专业人士：
- 如果双方对费用分摊方式或分割单的开具存在疑问，可以咨询财务、税务或法律方面的专业人士，以确保操作的合法性和有效性。
保留相关证据：
- 无论双方是否签订书面协议，都应保留与变压器使用、费用支付等相关的证据，如发票、付款凭证、使用记录等，以备不时之需。
四、可能的法律后果
- 如果双方未就费用分摊方式达成明确约定，且在实际操作中引发争议，可能会导致双方关系紧张，甚至影响变压器的正常使用。
- 在争议解决过程中，如果一方被认定存在过错或违约行为，可能需要承担相应的法律责任，如赔偿损失等。
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