服务协议上只有乙方签字，没有甲方签字盖章，一般情况下是无效的，但在某些特殊情况下可能被视为有效。以下是对这一问题的详细分析：
一、通常无效的情形
根据《民法典》的相关规定，合同作为双方意思表示一致的协议，应当采用书面形式，并且自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在服务协议中，如果只有乙方签字，而甲方没有签字或盖章，那么从形式上看，这份合同可能并未正式成立，因此在一般情况下应认定为无效。
二、特殊有效的情形
尽管签字是合同成立的重要形式要件，但在某些特定情况下，即使合同未签字，也可能被视为有效。这些特殊情况包括：
实际履行与接受：如果乙方已经按照合同约定实际提供了服务，而甲方也接受并享受了这些服务，那么根据《民法典》的相关规定，一方履行主要义务，对方接受时，该合同视为成立。这种情况下，尽管合同没有甲方的签字或盖章，但双方以实际行动表明了合意，合同因此被认定为有效。
盖章或按手印的替代：在签字缺失的情况下，如果甲方加盖了有效印章，或者按了指印，这些行为在法律上与签字具有同等的法律效力。因此，这种情况下服务协议同样被视为有效。不过，这一情形在本问题中并不直接适用，因为问题明确指出甲方没有签字盖章。
特殊主体或授权代表：如果甲方是法人或其他组织，且其法定代表人或授权代表在合同上签字或盖章，即使甲方本身没有直接签字或盖章，该合同也可能被视为有效。但这一情形同样需要具体的授权文件或证据来支持。
三、实践中的处理建议
完善合同签订手续：为了避免潜在的法律纠纷，建议双方在合同签订阶段尽可能确保所有相关方都完成签字、盖章或按手印等手续。这是确保合同有效性的最直接和有效的方式。
保留相关证据：在合同履行过程中，双方应保留好相关证据，如服务记录、支付凭证等，以证明合同的实际履行和接受情况。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中具有重要的证明作用。
及时寻求法律意见：如果双方对合同的效力存在争议，或者合同履行过程中出现了问题，建议及时寻求专业法律意见。通过法院或仲裁机构进行裁决，可以更有效地解决争议并保护双方的合法权益。
总结来看，服务协议上只有乙方签字而没有甲方签字盖章，在一般情况下是无效的。但在某些特殊情况下，如双方以实际行动表明了合意或甲方有特殊授权等，该合同也可能被视为有效。因此，在签订和履行服务协议时，双方应尽可能完善合同签订手续并保留好相关证据，以避免潜在的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。