针对您提出的“非法改装电动自行车撞自行车了怎么处理”这一问题，我将结合相关法律法规和实际案例，为您详细解答。

首先，需要明确的是，非法改装电动自行车是违反相关法律法规的行为。根据《电动自行车安全技术规范》等相关标准，电动自行车有其特定的技术参数和安全要求，非法改装（如更换大功率电池、电机等）可能导致车辆性能超出安全范围，增加事故风险。

当非法改装的电动自行车与自行车发生碰撞时，处理流程通常如下：

1. 现场处理：

   • 立即停车，保护现场，确保受伤人员得到及时救治。
   • 报警并等待交警到场处理。交警会进行现场勘查，记录事故情况，包括车辆状况、碰撞位置、伤者情况等。

2. 责任认定：

   • 交警会根据现场勘查结果、证人证言、监控视频等证据，对事故责任进行认定。
   • 如果电动自行车存在非法改装行为，且该行为对事故发生具有作用力（如导致车辆超速、制动失灵等），那么改装商家也可能被纳入事故责任方。

3. 法律后果：

   • 对于电动自行车驾驶人，如果因其非法改装行为导致事故发生，将承担相应的法律责任，包括民事赔偿和可能的行政处罚。
   • 对于非法改装商家，根据上海警方的明确规定，如果其改装行为导致车辆严重超速行驶、对事故发生具有作用力，那么商家将担责并作民事赔偿。今年以来，已有多个非法改装商家被纳入事故责任方追责。

4. 具体案例参考：

   • 以您提到的上海浦东新区案例为例，当事人方某驾驶非法改装的电动自行车超速行驶，与行人杨某相撞，造成杨某头部受伤。经调查，涉案电动自行车存在非法改装嫌疑，且改装行为对事故发生具有作用力。最终，方某承担事故主要责任，杨某承担次要责任，而两家非法改装店铺的经营者也各自承担了事故次要责任，并依法承担了相应的民事赔偿责任。

5. 建议与预防：

   • 作为电动自行车驾驶人，应严格遵守相关法律法规，不进行非法改装，确保车辆安全性能符合标准。
   • 作为商家，应诚信经营，不提供非法改装服务，共同维护道路交通安全。

综上所述，非法改装电动自行车撞自行车后，处理流程包括现场处理、责任认定、法律后果等环节。同时，我们也应从中吸取教训，加强安全意识，共同营造安全的道路交通环境。