患有重大传染病的犯罪者，在符合法定条件时，通常不会被直接关押进普通监狱，而是会根据具体情况采取监视居住、暂予监外执行或在特定医疗机构服刑等措施。以下是对此问题的详细分析：
一、侦查、审查起诉阶段（未决犯）的处理
看守所评估与不收押情况：
- 在这一阶段，犯罪嫌疑人通常会被关押在看守所。然而，如果其患有严重传染病，且该传染病具有较强的传染性，看守所可能会进行评估，并因可能对其他在押人员和监管工作人员的健康构成威胁而决定不予收押。
监视居住措施：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》，对符合逮捕条件但患有严重疾病、生活不能自理的犯罪嫌疑人，可以执行监视居住。对于患有严重传染病的犯罪嫌疑人，司法机关可能会决定在其住处或指定居所执行监视居住，以确保公共安全和犯罪嫌疑人的医疗照顾。同时明确，不得在羁押场所或专门的办案场所执行监视居住。
二、审判后（已决犯）的处理
监狱服刑与暂予监外执行：
- 通常情况下，罪犯会被送往监狱服刑。但如果罪犯患有严重传染病需要保外就医，监狱会进行诊断、检查，并按照相关规定办理暂予监外执行手续。依据相关法律法规，对被判处有期徒刑或者拘役的罪犯，若确有严重疾病需要保外就医，可由省级人民政府指定的医院诊断并开具证明文件。交付执行前由人民法院决定，交付执行后则由监狱或看守所提出书面意见，报省级以上监狱管理机关或设区的市一级以上公安机关批准。
特殊监管场所的安排：
- 部分地区设有病犯监狱或监管病区，专门用于收押患有严重疾病（包括传染病）的罪犯。这些场所具备专业的医疗设施和隔离条件，旨在保障其他在押人员的健康安全，并确保患病罪犯得到适当的监管和治疗。
三、特殊处理与综合考量
- 尽管犯罪者患有严重传染病，但他们仍需为其犯罪行为承担法律责任。法律机构在处理此类案件时，会采取一系列特殊措施，确保患者得到适当的医疗照顾，并防止疾病传播。
- 对于病情特别严重或需要长期治疗的犯罪者，可能会被安排在特定的医疗机构中服刑，直至病情得到控制或治愈。这样做既体现了法律的严肃性，也兼顾了人道主义关怀和公共卫生安全。
四、法律依据与程序要求
- 上述处理措施均依据相关法律法规进行，确保程序的合法性和正当性。例如，《暂予监外执行规定》就明确了哪些情况下罪犯可以暂予监外执行，包括患有严重疾病需要保外就医的情形。
- 在处理此类案件时，法律机构会严格遵循法定程序，确保犯罪者的合法权益得到保障，同时维护公共安全和社会秩序。
总结与建议：
- 对于患有重大传染病的犯罪者，法律机构会根据具体情况采取灵活多样的处理方式，以确保公共安全、维护法律秩序，并充分尊重和保护人权。
- 如果您或您身边的人遇到此类问题，建议及时咨询专业律师，了解具体的法律程序和权利保障措施。同时，提供相关的医疗证明和病情资料，以便法律机构做出更准确的判断和决策。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。